Glossaire

Acide gras à chaine courte

Les acides gras à chaîne courte (AGCC) sont des produits de la fermentation des fibres alimentaires non absorbées et non digérées par l’organisme. Cette fermentation est réalisée par des bactéries anaérobies du microbiote présentes dans le côlon. Les AGCC sont composés d’un maximum de six atomes de carbone et sont impliqués dans le métabolisme énergétique.

Actinobactéries

Phylum ou groupe d’eubactéries Gram-positives anaérobies ; elles font partie du microbiote dominant du côlon de l’homme.

Anaérobie

Qualifie un organisme qui se développe en l'absence d'oxygène.

Anatomique

Qui est relatif à l'anatomie. L'anatomie est une science qui étudie les parties du corps des êtres vivants et leurs relations : formes, structures, rapports entre les organes…

Anti-inflammatoire non stéroïdien (AINS)

Médicament anti-inflammatoire ayant une action contre l'inflammation, la fièvre et la douleur.

Anti-TNFa

Ou inhibiteur du facteur de nécrose tumorale (TNF = tumor necrosis factor) Médicament ayant une action anti-inflammatoire et prescrit dans le traitement de certaines maladies inflammatoires chroniques (MICI, Polyarthrite inflammatoire,...)

Antifongique

Médicament prescrit dans le traitement des maladies infectieuses dues à des champignons (mycoses)

Athérosclérose

Maladie de l'artère caractérisée par la perte élasticité de la paroi artérielle due à des dépôts de lipides (plaque d'athérome)

Axénique

Dépourvu(e) de microbiote

Bactériophage

Virus infectant spécifiquement les bactéries

Bactériothérapie

Traitement d'une maladie infectieuse par introduction dans l'organisme de bactéries spécifiques

Bactéroïdes

Genre bactérien à Gram négatif anaérobies, appartenant à l'embranchement des Bacteroidetes. Les bactéroïdes sont retrouvés au niveau du tube digestif et des muqueuses, ils constituent une partie importante de la flore intestinale.

Bacteroidetes

Phylum composé de trois grandes classes de bactéries qui sont dominantes dans le côlon, notamment les genres Bacteroides et Porphyromonas.

Bifidobactérie

Bactérie du genre Bifidobacterium à Gram positif, non mobile présente dans la flore intestinale.

Bifidobacterium

Genre bactérien anaérobies à Gram positif, appartenant à l'embranchement des Actinobacteria .

Butyrate

Acide gras à chaîne courte qui agit sur le bon fonctionnement des cellules de la muqueuse du côlon

Caecum

Partie initiale du gros intestin.

Candidose

Infection due à un champignon du genre Candida, touchant la peau ou les muqueuses au niveau de la bouche ou des parties génitales (vagin…)

Canneberge

Fruit à baies rouges.

carmin

Colorant rouge.

Chlamydias

Bactérie responsable, chez l'être humain, de nombreuses affections génitales, oculaires et respiratoires aiguës et chroniques.

Cognitif/ve

Qui est relatif à la faculté de connaître

Colonocyte

Cellule de la membrane épithéliale du colon.

Coloscopie

Examen qui permet d'explorer la muqueuse du colon.

Corticostéroïde

(ou corticoïde) Désigne les hormones sécrétées par les glandes surrénales et les médicaments produits par synthèse, ayant les mémes effets que ces hormones : effets anti-inflammatoires et immunomodulateurs.

Corticothérapie

Traitement utilisant des corticoïdes.

Cystite

Inflammation de la vessie traduisant le plus souvent une infection urinaire.

DAA

Diarrhée liée aux antibiotiques.

Dermatite atopique

ou Eczema allergique. Maladie non contagieuse de la peau associant sécheresse cutanée et démangeaisons et favorisée par une prédisposition aux allergies.

Dermatose

Maladie de la peau.

Dermocorticoïde

Cortocoïde utilisé dans le traitement de maladies de la peau.

Diabète

Maladie chronique liée à un dysfonctionnement de la production ou de l'utilisation de l'insuline, hormone qui régule la glycémie.

Dopamine

Molécule chargée de transmettre l'information entre les neurones. La dopamine est impliquée dans le contrôle de la motricité.

Duodénum

Première partie de l'intestin grêle située à la sortie de l'estomac.

Dysbiose

Déséquilibre du microbiote associé à des conséquences néfastes pour l’hôte. Une dysbiose peut résulter de l’excès de micro-organismes délétères et/ou de l’insuffisance relative de micro-organismes bénéfiques à l’hôte.

Écosystème

Association d’êtres vivants et de leur environnement biologique.

Entérique

Qui concerne les intestins.

Entérotype

Type de composition bactérienne caractéristique d'un microbiote. Actuellement, 3 entérotypes ont été identifiés chez l'être humain.

Enzymatique

Relatif à l'action d'une enzyme, protéine impliquée dans des réactions chimiques de l'organisme.

Épithélial

Qui est relatif à l'épithélium.

Épithélium

Tissu mince formé d'une ou plusieurs couches de cellules juxtaposées. Il en existe deux types : épithélium de revêtement (peau ou muqueuse), épithélium glandulaire (fonction de sécrétion) .

Escherichia coli

(ou colibacille) Bactérie intestinale à Gram négatif, très commune chez l'homme (commensales). Mais, certaines souches (pathogènes) peuvent entraîner des troubles (gastroentérites, infections urinaires…)

Faecalibacterium prausnitzii

Principale espèce de firmicute du côlon humain, producteur, entre autres, de butyrate. Son taux est diminué au cours de la maladie de Crohn.

Fèces

(ou selles ou excréments) Résidus de la digestion excrétés au terme du transit digestif par défécation.

Firmicutes

Phylum constitué de bactéries Gram + incluant les Clostridies et lactobacilles, dominant dans le côlon de l’homme.

Fructane

Sucre complexe constitué de polymères de fructose. Ils sont produits par les micro-organismes ou les plantes. Il existe différentes catégories de fructanes dont l'inuline

Fructo-oligosaccharide (FOS)

Sucre complexe composé de fructose et saccharose. Ils représentent les prébiotiques quantitativement les plus importants, présents naturellement dans les aliments.

Fructosane

Sucre complexe (polysaccharide) composé de polymères de fructose.

Galacto-oligosaccharide (GOS)

Sucre complexe composé composé d'oligosaccharide et de galactose. Les GOS sont présents notamment dans le lait maternel.

Genre

Rang taxinomique regroupant un ensemble d’espèces.

Gonocoque

Bactérie à Gram négatif, responsable d'infection génitale sexuellement transmissible (gonococcie ou blennorragie)

Gram+/-

Correspond à une classification bactérienne mise en évidence par une technique de coloration appelée coloration de Gram. Alors que les bactéries à Gram positif apparaissent en mauves au microscope, les bactéries à Gram négatif apparaissent en rose. La technique de coloration repose sur les caractéristiques membranaires et de paroi de la bactérie.

Helicobacter pylori

Bactérie présente dans estomac et pouvant survivre dans un environnement très acide. H Pylori est impliqué dans la majorité des cas d'ulcère de l'estomac ou du duodénum.

Hôte

Organisme (homme, animal…) qui héberge un virus, un parasite, une bactérie... Se dit aussi d'une personne recevant une greffe.

Immuno-modulateur

Composé moléculaire qui active ou freine les réactions immunitaires (modulation)

Infantile

Qui est relatif à l'enfant.

Insulinorésistance

Résistance de l'organisme à l'action hypoglycémiante (diminution du glucose dans le sang) par l'insuline.

Intestin

Partie du tube digestif constitué par le duodénum, le jéjunum, l'iléon, le cæcum, le côlon et le rectum.

Inuline

Fructane issu de la racine de chicorée ou des artichauts et fait partie des prébiotiques.

Lactobacilles

Genre bactérien regroupant les bactéries à Gram positif , intervenant dans la fermentation des glucides et leur transformation en acide lactique. Les lactobacilles sont des organismes importants de la flore intestinale.

Levure

Champignon microscopique constitué d'une seule cellule (unicellulaire). Certaines levures agissent sur la fermentation des aliments et sont utilisées dans la cuisine (levure de bière..). D'autres sont utilisées à des fins thérapeutiques (Saccharomyces boulardii). Certaines peuvent être responsables de maladies (ex. candidose à Candida albicans)

Lipopolysaccharide

Composé constitué de lipides et de glucides.

Maladie coeliaque

Maladie digestive auto-immune due à une intolérance au gluten.

Mésentère

Le mésentère est une membrane correspondant au repli du péritoine (membrane recouvrant la cavité et les organes de l'abdomen), reliant le jéjunum et l'iléon (portions de l'intestin grêle) à la paroi postérieure de l'abdomen. Il contient des nerfs et des vaisseaux.

Mésentérique

Qui est relatif au mésentère.

Métabolique

Qui est relatif au métabolisme

Métabolisme

Ensemble des réactions chimiques de transformation de matière et d'énergie qui se produisent dans l'organisme, au niveau des cellules

Métabolite

"Produit qui se forme lors d'un processus de transformation d'un corps organique (métabolisme) au sein d'une cellule, d'un tissu ou du milieu sanguin.
Définit aussi un produit qui entre dans le processus métabolique"

Métabolome

Ensemble des métabolites intermédiaires ou terminaux du microbiote.

Métagénomique

Procédé qui vise à étudier le contenu génétique d'un échantillon issu d'un environnement complexe (comme l’intestin)

Métaprotéomique

Procédé qui vise à étudier le contenu en protéines d'un échantillon issu d'un environnement complexe (comme l’intestin).

Métatranscriptomique

Procédé qui vise à étudier le contenu en ARN d'un échantillon issu d'un environnement complexe (comme l’intestin).

MICI

Maladie inflammatoire chronique de l'intestin.

Microbiote

Ensemble des micro-organismes (bactéries, levures, champignons, virus) vivant dans un environnement spécifique.

Mucus

Sécrétion visqueuse produite par les cellules des muqueuses et ayant une fonction de protection.

Muqueuse colique

Couche de cellules recouvrant le côlon.

Norovirus

Virus couramment responsable de gastroentérites et de diarrhées dans les pays développés.

Noyau (ou « core ») bactérien intestinal

Partie du microbiote partagée par l’ensemble ou une grande majorité des individus.

Oligosaccharide

Sucre composé d'un ensemble de un à une dizaine de molécules de sucres simples (monosaccharides ou oses)

Parentérale

Qui est relatif à l'administration d'un médicament par voie intraveineuse, intramusculaire ou sous-cutanée

Pathobionte

Ensemble de bactéries pouvant provoquer des maladies.

Pathogène

Qui peut provoquer une maladie.

Perannuelle

Pouvant se dérouler à tout moment de l'année (pas d'influence par exemple des saisons

Phylogénétique

Correspond à l’étude des liens existant entre espèces apparentées. Grâce à elle, il est possible de retracer les principales étapes de l’évolution des organismes depuis un ancêtre commun et ainsi de classifier plus précisément les relations de parenté entre les êtres vivants.

Phylum

Deuxième rang taxonomique, il regroupe un ensemble de genres et d’espèces (synonyme : embranchement).

Polype

Tumeur de forme pédiculée (structure allongée), le plus souvent bégnine qui se développe dans les cavités de l'organisme revêtues d'une muqueuse (intestin, oesophage, vessie, nez…)

Polysaccharide

Sucre de haut poids moléculaire composé de nombreuses molécules de sucres simples (monosaccharides ou oses)

Prébiotique

Fibres non-digestibles du régime alimentaire qui stimulent de manière sélective, au niveau du côlon, la croissance des bactéries du microbiote qui ont un effet bénéfique sur la santé de l’hôte.

Prevotella

Genre bactérien à Gram négatif appartenant à l'embranchement des Bacteroidetes.

Probiotique

Micro-organismes vivants qui, lorsqu’ils sont ingérés en quantités suffisantes, exercent un effet bénéfique sur la santé de l’hôte.

Prophylactique

Qui préserve la santé de l'apparition, aggravation ou extension de maladies

Rectocolique hémorragique

(ou colite ulcéreuse) Maladie inflammatoire du rectum et du côlon, faisant partie des MICI

Réponse immunitaire

Réaction de défense d'un organisme impliquant les cellules immunitaires.

Résilience

Capacité d’un écosystème ou d’une espèce à récupérer un fonctionnement ou un développement normal après avoir subi un traumatisme. Quand le microbiote est perturbé par un antibiotique, il aura (le plus souvent) tendance à retrouver son équilibre après un certain temps.

Rotavirus

Virus pouvant être responsable de gastro-entérite

Ruminococcus

Genre de bactéries à gram positif appartenant à l'embranchement des Firmicutes.

Salmonelle

Bactérie pouvant être responsable de la survenue d'intoxications alimentaires à l'origine de gastro-entérite.

Sels biliaires

Composés issus de cholestérol qui ont un rôle dans la digestion des graisses.

Souche

Rang taxonomique au-dessous de celui d’espèce.

Stéatose

Surchage en graisses des cellules

Streptomycine

Antibiotique de la classe des aminosides.

Symbiotique

Qui est relatif à la symbiose (= association inter-dépendante entre 2 organismes ne pouvant vivre l'un sans l'autre et tirant des bénéfices l'un de l'autre).

Taxonomie

Science de la classification des êtres vivants qui a pour objet de les décrire et de les regrouper en entités appelées taxons (familles, genres, espèces, etc.) afin de pouvoir les nommer et les classer.

TFI

Trouble fonctionnel de l'intestin.

Tractus

Définit la fois, un ensemble d'organes composant un système (ex :tractus digestif), et aussi, un ensemble de fibres (conjonctives ou nerveuses) situées à la surface ou dans l'épaisseur d'un organe.

Tractus intestinal

Ensemble des organes qui constituent les intestins.

Trophique

Qui est relatif à la croissance des organes, des tissus vivants, d'un individu.

Vaginose bactérienne

Infection vaginale due à un déséquilibre de la flore bactérienne du vagin.

Villosité

Ensemble de petites saillies en forme de "poils" qui tapissent la surface notamment de muqueuses (ex. intestin) et donnent un aspect velu.





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