Diarrhée infectieuse

L’équilibre intestinal est fortement affecté en cas de diarrhée infectieuse. L’étude de l’écosystème microbien au cours de l’infection a permis des progrès notables dans la prise en charge de cette pathologie.

Les diarrhées infectieuses regroupent la majorité des gastro-entérites, diarrhées aiguës (c’est-à-dire durant moins de 2 semaines) et diarrhées du voyageur. Les étiologies infectieuses (virales, bactériennes ou parasitaires) prédominent dans ces diarrhées. Elles sont un problème de santé publique majeur dans les pays en voie de développement, dans lesquels 760 000 enfants en meurent chaque année1. Dans les pays développés aussi, les enfants sont les plus touchés. Cependant, bien traitées, les gastro-entérites (dues le plus souvent à des rotavirus ou des adénovirus) évoluent presque toujours favorablement. 

Un équilibre bouleversé 

 Si la sensibilité aux diarrhées infectieuses semble dépendre du profil microbien de chacun2, la survenue de ces dernières perturbe en retour la composition du microbiote intestinal. Des études ont montré que, lors de diarrhées infectieuses d’origine bactérienne ou virale, la diversité bactérienne chute pendant plusieurs semaines, avec notamment une forte diminution de la proportion de bactéries des familles Bacteroidetes et Firmicutes3,4.

De possibles conséquences à long terme Le microbiote est résilient, ce qui lui permet de retrouver un état d'équilibre proche de son état initial au bout de quelques semaines après une diarrhée5. Néanmoins, des études suggèrent que des modifications persistant sur le long terme pourraient avoir des conséquences néfastes sur la santé, en favorisant notamment le développement d'un syndrome de l'intestin irritable6.

Une meilleure prise en charge

Le traitement doit en premier lieu lutter contre la déshydratation. En complément de la réhydratation, des études suggèrent que la prise de probiotiques tels que Saccharomyces boulardii pourrait limiter l'importance et la durée de la gastroentérite infectieuse, en accélérant le rétablissement de l’équilibre microbien7,8.

Sources
1- Maladies diarrhéiques. In : OMS [en ligne]. Avril 2013. [consulté le 30/12/2016]. Disponible à l'adresse :  http://www.who.int/mediacentre/factsheets/fs330/fr/
2- Lindsay B,et al. Microbiota that affect risk for shigellosis in children in low-income countries. Emerg Infect Dis 2015 ; 21 : 242-50. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4313639/pdf/14-0795.pdf
3- Monira S et al.. 2013. Metagenomic profile of gut microbiota in children during cholera and recovery. Gut Pathog5:1. doi:.10.1186/1757-4749-5-1 https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3574833/pdf/1757-4749-5-1.pdf
4- Ma C, et al. Molecular characterization of fecal microbiota in patients with viral diarrhea. Curr Microbiol 2011 ; 63 : 259-66. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/?term=Ma+C%2C+Wu+X%2C+Nawaz+M%2C+et+al.+Molecular+characterization+of+fecal+microbiota+in+patients+with+viral+diarrhea.+Curr+Microbiol+2011+%3B+63+%3A+259-66.
5- Balamurugan R et al.. Molecular studies of fecal anaerobic commensal bacteria in acute diarrhea in children. J Pediatr Gastroenterol Nutr 2008 ; 46 : 514-9. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18493205
6- Beatty JK, Bhargava A, Buret AG. Post-infectious irritable bowel syndrome: mechanistic insights into chronic disturbances following enteric infection. World J Gastroenterol. 2014;20:3976–3985. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3983453/pdf/WJG-20-3976.pdf
7- Allen SJ et al.  Probiotics for treating acute infectious diarrhea. Cochrane Database of Systematic Reviews 2010, Issue 11. Art. No.: CD003048. DOI: 10.1002/14651858.CD003048.pub3 http://www.cochrane.org/CD003048/INFECTN_probiotics-for-treating-acute-infectious-diarrhoea 
8- Dinleyici EC et al.. Effectiveness and safety of Saccharomyces boulardii for acute infectious diarrhea. Expert Opin Biol Ther 2012 ; 12 : 395-410

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