Bağırsak mikrobiyom bileşimi, hastaların sağlıklı birinci derece akrabalarında Crohn hastalığının ileride oluşması ile ilişkilidir
MAKALE YORUMLARI - Yetişkin Bölümü
By Pr. Harry Sokol
Gastroenteroloji ve Beslenme Bölümü, Saint-Antoine Hastanesi, Paris, Fransa
Genel halk için bölüm
Özel alanınızı burada bulun
Bu makale hakkında
Yazar
Yayın
21 Ekim 2024
Güncelleme
22 Ekim 2024
Raygoza Garay ve diğerlerinin Gastroenterology 2023 makalesine ilişkin yorum [1]
Background Dayanak ve amaçlar: Crohn hastalığının (CD) nedeni bilinmemektedir, ancak mevcut hipotez, mikrobiyal veya çevresel faktörlerin genetik olarak duyarlı bireylerde bağırsak iltihabını tetikleyerek kronik bağırsak iltihabına yol açtığı yönündedir. ÇH'li hastalarda yapılan vaka-kontrol çalışmaları bağırsak mikrobiyom bileşimindeki değişiklikleri listelemiştir; ancak bu çalışmalar bağırsak mikrobiyom bileşimindeki değişikliğin ÇH'nin başlangıcıyla mı ilişkili olduğunu yoksa inflamasyonun veya bir ilaç tedavisinin sonucu mu olduğunu ayırt edememektedir. Yöntemler: Bu prospektif kohort çalışmasında, ÇH'li hastaların 3.483 sağlıklı birinci derece akrabası, hastalığın başlangıcından önceki bağırsak mikrobiyom bileşimini ve bu bileşimin ÇH gelişme riskini ne ölçüde öngördüğünü belirlemek için çalışmaya alınmıştır. Gelecekte ÇH gelişimi ile ilişkili bir mikrobiyal iz tanımlamak için bağırsak mikrobiyom bileşiminin analizine (16S ribozomal RNA dizilemesine dayalı) bir makine öğrenimi yöntemi uygulanmıştır. Modelin performansı bağımsız bir doğrulama kohortunda değerlendirilmiştir. Sonuç: Bu çalışma, bağırsak mikrobiyom bileşiminin gelecekte ÇH gelişimiyle ilişkili olduğunu gösteren ilk çalışmadır ve bağırsak mikrobiyomunun Crohn hastalığının patogenezine katkıda bulunduğunu düşündürmektedir.
Görsel
Bu konu hakkında şimdiye kadar ne biliyoruz?
Crohn hastalığı (CD), bağırsağın tekrarlayan kronik enflamasyonu ile karakterize enflamatuar bir bağırsak hasta-lığıdır (IBD). ÇH'nin nedeni bilinmemek-tedir, ancak mevcut hipotez mikrobiyal veya çevresel faktörlerin genetik olarak yat-kın bireylerde bağırsak iltihabını tetik-leyerek iltihaplanmaya ve kronik lezyonlara yol açtığı yönündedir. ÇH'li hastalarla yapılan vaka-kontrol çalışmaları, bağırsak mikrobiyom bileşimindeki değişiklikleri listelemiştir [1]. Ancak bu çalışmalar, değişen bağırsak mikrobiyom bileşiminin Crohn hastalığının başlangıcıyla mı ilişkili olduğunu yoksa inflamasyonun veya bir ilaç tedavisinin sonucu mu olduğunu ayırt edememektedir. Bu soruları yanıtlamak için, Crohn hastalığı olan bireylerin sağlıklı birinci derece akrabalarında prospektif bir kohort çalışması olan Kanada projesi GEM (Genetic Environmental Microbial), Crohn hastalığının gelişimi ile ilişkili parametreleri belirlemek için tasarlanmıştır. Yazarlar, parametreler arasında, CD'nin başlangı-cından önceki bağırsak mikrobiyom profilini ve bu bileşimin CD geliştirme riskini ne ölçüde öngördüğünü inceledi. Yazarlar, Crohn hastalığı olan bireylerin sağlıklı birinci derece akrabalarından oluşan geniş bir kohortta (N = 3.483) bağırsak mikrobiyo-munun bileşiminin analizine, CD geliştirme riski ile ilişkili bir mikrobiyal imza tanım-lamak amacıyla bir makine öğrenimi yönte-mi uyguladı.
Görsel
Bu çalışmadan elde edilen temel bulgular nelerdir?
Yazarlar, GEM kohortundan elde edilen verilere dayanarak, gelecekte KD geliştirecek bireyleri sınıflandırmak için kullanılan bir mikrobiyom risk skoru (MRS) geliştirerek doğrulamışlardır. MRS'ye en fazla katkıda bulunan taksonlar, MRS ile pozitif korelasyon gösteren Ruminoccus torques ve Blautia 'nın artan miktarı iken (bu taksonların zararlı bir etkisi olduğunu düşündürmektedir), Roseburia cinsinin fazlalığı MRS ile negatif korelasyon göstermiştir (bu cinsin koruyucu bir etkisi olduğunu düşündürmektedir). Son olarak yazarlar, Faecalibacterium cinsinin miktarındaki artışın MRS'deki artışla ters orantılı olduğunu gözlemlemişlerdir. Bu çalışma, Faecalibacterium miktarındaki azalmanın, hastalığın başlangıcından yıllar önce gözlenebilen, CD'nin preklinik bir belirtisi olabileceğini gösteren ilk çalışmadır ve bu antiflamatuar bakterideki azalma ile nedensel bir ilişki olduğunu düşündürmektedir [2]. Anlamlı bir şekilde ÇH'nin başlangıcından önce mikrobiyom-daki değişiklikler bağırsak iltihabının var-lığından bağımsız olarak gözlenmiştir (fe-kal kalprotektin seviyeleri ile gösterilmiş-tir) Yazarlar ayrıca kohortun bir alt gru-bundan alınan dışkı örneklerinin metabo-lomik analizini de gerçekleştirmişlerdir. Sitozin ve türevi olan sitidin, MRS ile en güçlü negatif korelasyonu göstermiştir. Ayrıca, MRS'nin pre-KH imzası, gentisat ve nikotinat gibi anti-enflamatuar veya antioksidan aktiviteye sahip metabolitlerde azalma ile ilişkilendirilmiştir. Bu koruyucu metabolitler aynı zamanda Faecalibacterium ve Lachnospira bolluğu ile pozitif korelasyon göstermiştir ki bu da bu metabolitlerin çokluğu ile mikrobiyal kompozisyon arasında potansiyel bir biyolojik etkileşim olduğunu göstermektedir
Key points
- The gut microbiota becomes altered several years before the diagnosis of Crohn’s disease, independently of the existence of intestinal inflammation, suggesting that the microbiome has a causal role in Crohn’s disease
- A Microbiome Risk Score may identify subjects at most risk of developing Crohn’s disease
- Early action targeting the microbiome may be proposed in patients identified as being at risk of developing Crohn’s disease
Pratikteki etkileri ne olacaktır?
Bu çalışma, Crohn hastalığına yaka-lanma riski taşıyan sağlıklı bireylerin mik-robiyomunun analiz edilmesinin, yüksek risk altındaki kişileri belirleyebileceğini ve böylece bu kişilerin yakından izlen-mesine ve mikrobiyal dengesizliği değiş-tirmek ve dolayısıyla hastalığa yakalan-ma riskini azaltmak için tasarlanmış mü-dahalelerin başlatılmasına olanak sağla-yabileceğini öne sürmektedir.
SONUÇ
Bu çalışma, bağırsak mikrobiyomu bileşimindeki değişikliklerin Crohn hastalığı tanısından yıllar önce meydana geldiğini gösteren ilk çalışmadır. Bu durum, bağırsak mikrobiyomunun Crohn hastalığının patogenezine katkıda bulunduğunu ve önleme ve/veya tedavi için potansiyel bir hedef olabileceğini düşündürmektedir.
Sources
1. Sartor RB, Wu GD. Roles for Intestinal Bacteria, Viruses, and Fungi in Pathogenesis of Inflammatory Bowel Diseases and Therapeutic. Approaches. Gastroenterology 2017; 152: 327-39.e4.
2. Sokol H, Pigneur B, Watterlot L, et al. Faecalibacterium prausnitzii is an anti-inflammatory commensal bacterium identified by gut microbiota analysis of Crohn disease patients. Proc Natl Acad Sci USA 2008; 105: 16731-6.