Bénéfices à long-terme d’un traitement par transfert de microbiote sur les symptômes autistiques et le microbiote intestinal

Commentaire de l’article original de Kang et al. (Sci Rep 2019) [1]

Que sait-on déjà à ce sujet ?

Les enfants autistes souffrent de divers symptômes gastro-intestinaux (constipation, diarrhée, ballonnement). En outre, il existe chez les enfants autistes une dysbiose du microbiote intestinal caractérisée par une augmentation du ratio Firmicutes/ Bacteroidetes en raison d’une diminution des Bacteroidetes. Cette dysbiose perturberait l’axe intestin-cerveau, et favoriserait à la fois les symptômes digestifs et comportementaux liés à l’autisme. Le traitement par transfert de microbiote comprend une préparation digestive initiale avec antibiothérapie par vancomycine pendant 14 jours et préparation colique à J15, puis une transplantation fécale avec forte dose initiale de microbiote digestif humain standardisé (par voie orale ou rectale) et faible dose en entretien pendant 7-8 semaines, associées à un traitement par inhibiteurs de la pompe à protons à partir de J12. Kang et al. ont rapporté précédemment que ce traitement a permis une réduction de 80 % des symptômes digestifs et une réduction plus faible des symptômes comportementaux d’enfants autistes, associées à une modification du microbiote intestinal, avec un suivi de 8 semaines [2].

Quels sont les principaux résultats apportés par cette étude ?

Dans cet article, les auteurs ont réévalué les 18 enfants autistes deux ans après le traitement initial par transfert de microbiote. L’amélioration des symptômes digestifs, mesurés par questionnaire (Gastrointestinal Symptom Rating Scale), persistait avec une réduction de 58 % (Figure 1). Tous les symptômes digestifs étaient améliorés (douleurs, difficultés de digestion, diarrhée et constipation). Le transit était toujours amélioré, avec une réduction de 26 % du pourcentage de jours avec des selles anormales.

Les familles rapportaient une amélioration constante des signes autistiques. La sévérité des TSA était diminuée de 47 % par rapport au début de l’étude, évaluée par le Childhood Autism Rating Scale (Figure 2). Une amélioration de 35 % des comportements était notée par l’Aberrant Behavior Checklist ; cette amélioration se poursuivait car elle était de 24 % à la fin des huit semaines. Le microbiote intestinal a été analysé pour 16 des 18 enfants par analyse ARN 16S. La diversité bactérienne était plus élevée à deux ans qu’après huit semaines de suivi (Figure 3). Une abondance relative augmentée de Bifidobacterium et Prevotella persistait à deux ans, alors que celle de Desulfobivrio ne persistait pas de manière significative.

Quelles sont les conséquences en pratique ?

Ces résultats montrent que le traitement par transfert de microbiote a un effet persistant à long terme sur le microbiote intestinal. Il permet d’améliorer également de manière significative et durable les symptômes digestifs et comportementaux. Il est maintenant indispensable de réaliser une étude randomisée contrôlée en double aveugle chez des enfants autistes ayant ou non des signes digestifs. En effet, une dysbiose pourrait être présente et avoir un impact sur l’axe intestin-cerveau, même en l’absence de signes digestifs. Les résultats de cette étude doivent être confirmés avant une utilisation en pratique clinique.