Dr. Queen (lauréate USA 2020) : Microbiote et cancer colorectal
À l’occasion de la Journée mondiale du microbiote (#WorldMicrobiomeDay), Biocodex Microbiota Institute donne la parole aux lauréats des bourses nationales.
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Chapitres
A propos de cet article
Dr. Jessica Queen
En tant que médecin chercheuse, son objectif est de combiner son expertise clinique avec ses travaux de recherche afin d’améliorer la santé des patients pour tout ce qui concerne les agents pathogènes entériques et les microorganismes commensaux du tube digestif. Elle utilise des échantillons de malades et des modèles animaux pour étudier comment le microbiote intestinal contribue au développement du cancer du côlon et comment il peut modifier ou prédire la réponse des malades aux thérapies anticancéreuses.
Qu’est-ce que la bourse nationale vous a permis de découvrir dans votre domaine de recherche sur le microbiote?
Mon projet consiste à isoler et à caractériser des souches de Fusobacterium provenant de biopsies de cancer du côlon. Il s’agit d’un véritable projet translationnel que je trouve particulièrement intéressant en tant que médecin chercheuse car il me permet de travailler directement sur des échantillons de malades afin d’étudier l’observation importante selon laquelle le microbe oral Fusobacterium nucleatum est plus abondant dans le microbiote de nombreux malades atteints de cancer du côlon. Je disposais déjà de données pilotes encourageantes mais j’avais besoin de fonds supplémentaires et d’appui technique pour faire avancer le projet. La bourse nous a permis de terminer le séquençage de l’ARNr 16S de notre cohorte de biopsies de cancer du côlon, ce qui nous a ouvert un panorama plus large sur la composition bactérienne du microbiote tumoral. À présent, nous analysons ces données en fonction de certaines caractéristiques des malades (par exemple, le stade de la tumeur, sa localisation, les caractéristiques démographiques du malade). En parallèle, nous isolons des souches individuelles de Fusobacterium, nous effectuons un séquençage complet du génome de ces souches et nous les testons sur notre modèle de souris, ce qui fournit des informations sur le mécanisme par lequel ces microorganismes contribuent au cancer du côlon. Les données préliminaires accumulées jusqu’ici ont mis en lumière la diversité génomique de F. nucleatum et des phénotypes spécifiques de chaque souche dans des modèles de cancer colorectal (CCR) chez la souris (données publiées récemment dans mBio1). Nous disposons de données préliminaires encourageantes qui révèlent un nouvel effet cancérigène potentiel d’autres espèces de Fusobacterium.
Quelles sont les conséquences de cette découverte pour le patient ?
Notre analyse en profondeur de cette cohorte de CRC fournira des informations plus précises sur le microbiote tumoral car nous associons le séquençage, les cultures et les modèles in vivo pour étudier les microorganismes commensaux jusqu’au niveau de la sous-espèce et de la souche, ce qui n’avait jamais été fait jusqu’à présent pour Fusobacterium nucleatum. À terme, nous espérons qu’une compréhension plus profonde du microbiote associé au cancer créera des opportunités pour développer des interventions préventives et thérapeutiques novatrices et permettra d’adopter une approche plus personnalisée de la prise en charge des malades.
Quel conseil pourriez-vous nous donner pour prendre soin de notre microbiote ?
Je pense que l’une des choses les plus importantes que nous pouvons faire tant au niveau individuel que collectif est de limiter l’exposition inutile aux antibiotiques, qui peuvent bouleverser notre microbiote intestinal en bonne santé. En tant que spécialiste des maladies infectieuses, j’insiste beaucoup sur le contrôle de l’utilisation des antibiotiques car ils ont des implications importantes dans le développement de microorganismes résistants et les conséquences à long terme de la dysbiose.
