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Microrganismos intestinales asociados con la salud, la nutrición y las intervenciones dietéticas

ARTÍCULO COMENTADO - Adulto

Por el Prof. Harry Sokol, Gastroenterología y nutrición, Hospital Saint-Antoine, París, Francia

Comentario del artículo de Asnicar et al.¹ 

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Acerca de este artículo

Fecha de publicación 09 Noviembre 2026
Fecha de actualización 09 Noviembre 2026

La incidencia de las enfermedades cardiometabólicas está aumentando a escala mundial, y tanto una alimentación inadecuada como el microbioma intestinal humano se han relacionado con su aparición. Sin embargo, en este campo, faltan estudios exhaustivos y a gran escala que exploren estas relaciones en poblaciones diversas. A partir de una muestra de más de 34 000 participantes americanos y británicos, este estudio pone de relieve relaciones sólidas entre alimentación, microbioma intestinal y marcadores de salud cardiometabólica. Los autores han elaborado el «ZOE Microbiome Health Ranking 2025», una clasificación de especies microbianas en función de su relación favorable o desfavorable con la salud, validada en más de 7 800 muestras independientes. En ensayos de intervención dietética (746 participantes), las especies beneficiosas aumentaron mientras que las especies perjudiciales disminuyeron. Estos resultados refuerzan la relación entre alimentación, microbioma y salud, al tiempo que subrayan que los estudios prospectivos y de intervención siguen siendo necesarios para establecer una relación de causalidad.

¿Qué se sabe ya sobre este tema?

Las enfermedades cardiometabólicas, en concreto, las enfermedades cardiovasculares y la diabetes de tipo 2, constituyen la principal causa de morbimortalidad en los países occidentales². Si bien la alimentación es el principal factor de riesgo modificable, actualmente se reconoce que el microbioma intestinal es un actor clave del metabolismo, influido por la dieta e implicado en la obesidad, la resistencia a la insulina y la inflamación. Sin embargo, los estudios disponibles hasta ahora se basaban principalmente en pequeñas cohortes y poco diversificadas, con datos microbiológicos y fenotípicos limitados³⁻⁵, lo que dificultaba la identificación de biomarcadores microbianos fiables y universales, así como la definición de un «microbioma sano» aplicable a escala poblacional.

¿Cuáles son los principales resultados aportados por este estudio?

Para responder a estas preguntas, los autores agruparon y armonizaron cinco cohortes metagenómicas (de Estados Unidos y Reino Unido), que representan en total 34 694 participantes con datos obtenidos mediante secuenciación metagenómica indiscriminada o shotgun de gran profundidad, cuestionarios alimentarios validados y un panel completo de marcadores cardiometabólicos.

A partir de modelos de aprendizaje automático o machine learning entrenados con la abundancia relativa de 661 especies microbianas (definidas como species-level genome bins, o SGBs), los autores demostraron que el microbioma predice, de manera reproducible, aunque moderada, numerosos marcadores de salud cardiometabólica (AUC de 0,64–0,73 en la clasificación; correlación de Spearman 0,30–0,46 en regresión, figura 1).

El resultado más destacado es la elaboración del «ZOE Microbiome Health Ranking 2025», un sistema de clasificación de 661 especies, en función de su asociación neta con los marcadores de salud del anfitrión (salud personal, marcadores en ayunas, marcadores posprandiales) y con la calidad de la alimentación. Las especies mejor clasificadas (cercanas a 0), asociadas a un perfil metabólico favorable, pertenecen en su mayoría al filo Firmicutes, y a las clases Clostridia y Ruminococcaceae, pero en su gran mayoría no están caracterizadas: 22 de las 50 mejores especies son entidades desconocidas, representadas únicamente por genomas reconstruidos a partir de datos metagenómicos.

Entre las especies conocidas, Faecalibacterium prausnitzii y Eubacterium siraeum se encuentran entre las más favorables, un resultado coherente con los datos publicados. Al contrario, las especies con peor clasificación (cercanas a 1), asociadas a un perfil desfavorable, incluyen entidades ya conocidas por sus efectos nocivos: Ruminococcus gnavus, Ruminococcus torques, Flavonifractor plautii, Enterocloster bolteae y Eggerthella lenta.

A continuación, los autores validaron esta clasificación en más de 7 800 muestras públicas independientes: las personas obesas presentaban, de media, 1,95 especies desfavorables más que las personas con peso normal, y 5,2 especies favorables menos.

Por último, en dos ensayos clínicos de intervención dietética (n = 746), las especies clasificadas como favorables presentaban mayor abundancia y prevalencia tras la intervención, mientras que las especies desfavorables disminuyeron, lo que indica que el microbioma puede modificarse mediante la alimentación, aunque no se pueda establecer una relación causal.

Imagen
ES Figura 1

¿Cuáles son las consecuencias en la práctica?

Este estudio confirma, a gran escala, que el microbioma intestinal es un elemento medible y modulable de la salud cardiometabólica, y el «ZOE MB Health Ranking 2025» sirve como herramienta de estratificación que podría utilizarse para orientar recomendaciones dietéticas personalizadas o utilizarse como criterio intermedio en futuros ensayos.

Las implicaciones clínicas inmediatas siguen siendo limitadas: las asociaciones son correlativas, no se ha demostrado ningún mecanismo directo y la causalidad deberá establecerse mediante ensayos aleatorizados y controlados.

Para los investigadores, 22 de las 50 especies con mejor puntuación no están caracterizadas en absoluto, por lo que su cultivo y la identificación de sus metabolitos constituyen una prioridad. Asimismo, el estudio aboga por el uso sistemático de una secuenciación metagenómica indiscriminada en los grandes estudios epidemiológicos.

Puntos clave

  • Se trata del mayor estudio metagenómico combinado con datos alimentarios y clínicos.

  • La mayoría de taxones que se asocian favorablemente con la salud no se han cultivado y carecen de descripción fenotípica, lo que pone de manifiesto una importante laguna en la investigación sobre el microbioma.

  • Las especies favorables aumentan y las desfavorables disminuyen con una mejor alimentación, lo que respalda el principio de modificabilidad, pero no permite establecer causalidad.

CONCLUSIÓN

Este estudio representa un avance metodológico significativo en el campo de la metagenómica nutricional, ya que ofrece un sistema de clasificación microbiana reproducible a gran escala y entre distintas poblaciones. Confirma la relevancia del microbioma como marcador asociado a la salud cardiometabólica y refuerza la hipótesis según la cual la alimentación constituye un factor de modulación microbiana.

Sin embargo, no permite concluir que el microbioma tenga un papel causal en la enfermedad cardiometabólica, y sus implicaciones terapéuticas directas siguen siendo especulativas, a falta de ensayos de intervención específicos. Puede que el principal mérito de este trabajo sea que facilita, por fin, el mapa y las hipótesis necesarias para diseñar estos ensayos fundamentados.

Fuentes:

1. Asnicar F, Manghi P, Fackelmann G, et al. Gut micro-organisms associated with health, nutrition and dietary interventions. Nature 2026; 650: 450-8.

2.https://www.who.int/data/gho/data/themes/mortality-and-global-health-estimates/ghe-leading-causes-of-death.

3. Yatsunenko T, Rey FE, Manary MJ, et al. Human gut microbiome viewed across age and geography. Nature 2012; 486: 222-7.

4. Blanco-Míguez A, Beghini F, Cumbo F, et al. Extending and improving metagenomic taxonomic profiling with uncharacterized species using MetaPhlAn 4. Nat Biotechnol 2023; 41: 1633-44.

5. Pasolli E, Asnicar F, Manara S, et al. Extensive Unexplored Human Microbiome Diversity Revealed by Over 150,000 Genomes from Metagenomes Spanning Age, Geography, and Lifestyle. Cell 2019; 176: 649-62.e20.

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