CLOSTRIDIOIDES DIFFICILE: МАРКЕРЫ МИКРОБИОТЫ КИШЕЧНИКА ПОЗВОЛЯЮТ ПРЕДСКАЗАТЬ РИСК ВОЗНИКНОВЕНИЯ ИНФЕКЦИИ

Результаты исследования, проведенного в шести европейских странах, выявили маркеры микробиоты кишечника, позволяющие предсказать риск возникновения антибиотикоассоциированной диареи и инфекции, вызванной Clostridioides difficile. 

Дисбиоз, обусловленный применением антибиотиков, может привести к инфекции, вызванной Clostridioides difficile. Этот возбудитель связан с тяжелыми осложнениями и высокой смертностью, а борьба с ним дорого обходится системам здравоохранения всего мира. Выявление маркеров этой инфекции может улучшить ее лечение и уменьшить связанные с ней последствия.

Исследование с участием более 1000 пациентов из 34 клиник по всей Европе

В этом наблюдательном проспективном многоцентровом исследовании специалисты изучали микробиоту кишечника госпитализированных пациентов в возрасте старше 50 лет. За день до начала антибиотикотерапии всем участникам выполнили анализ на основе метода секвенирования 16S рРНК с типированием олигонуклеотидов для выявления C. difficile. Главная задача заключалась в выявлении микробных маркеров, позволяющих спрогнозировать риск развития антибиотикоассоциированной диареи (ААД) и инфекции, вызванной C. difficile (CDI). Также проводили продольный анализ для оценки влияния некоторых антибиотиков* на микробиоту кишечника. 

Прогностические маркеры для CDI

В течение 90 дней после начала лечения у 135 пациентов развилась диарея, которая в 15 случаях была связана с C. difficile. Исследователи заметили, что разнообразие микробиоты за 1 день до начала любой антибиотикотерапии было ниже у пациентов, у которых впоследствии развилась CDI, по сравнению с теми, кто перенес ААД, или пациентами без диареи. Состав микробиоты кишечника пациентов с CDI также отличался преобладанием Enterococcus и снижением количества Blautia, Ruminococcus, Porphyromonas, Bifidobacteria, Odoribacter, Prevotella и Ezakiella spp . Эти прогностические маркеры сравнивали с маркерами в канадской когорте пожилых пациентов с CDI. У них также отмечалось изменение разнообразия кишечной флоры в виде повышения содержания Enterococcus и снижения Ruminococcus, Ezakiella и Odoribacter spp. за 5 дней до начала инфекции. 

Дисбиоз, вызванный применением антибиотиков

Авторы выявили, что антибиотики вызывали дисбиоз, признаки которого обнаруживались уже через 6 дней после начала лечения. Больше всего страдала микробиота кишечника пациентов, получавших бета-лактамные антибиотики (не относящиеся к классу пенициллина). Все бета-лактамы, независимо от сочетания с ингибиторами бета-лактамаз, повышали содержание Enterococcus. Применение пенициллина в комбинации с ингибитором бета-лактамазы также приводило к уменьшению содержания бактерий семейства Clostridiales Incertae Sedis XI, которые, как известно, снижают риск развития CDI. Другие классы бета-лактамов вызывали уменьшение содержания Lachnospiraceae, включая виды, продуцирующие бутират, известные своим положительным влиянием на здоровье. В целом все изученные классы антибиотиков значительно изменяли состав микробиоты кишечника. Это согласуется с известным фактом о том, что применение антибиотиков сопряжено с высоким риском развития CDI.

 

* Пенициллин + ингибитор бета-лактамазы, другие классы бета-лактамов, фторхинолоны

 

Sources:

Berkell M., Mysara M., Xavier B.B. et al. Microbiota-based markers predictive of development of Clostridioides difficile infection. Nat Commun 12, 2241 (2021). https://doi.org/10.1038/s41467-021-22302-0