Microbiota fúngica: el efecto inesperado de un antibiótico estrella

Durante mucho tiempo, los hongos estuvieron ausentes de los estudios sobre la microbiota intestinal (MI) porque estos se interesaban preferentemente por los microorganismos mayoritarios, a saber, las bacterias. Por ello, se desconocen sus relaciones con las comunidades bacterianas de la MI y el impacto de los antibióticos sobre la micobiota intestinal. Un equipo de investigadores franceses decidió adentrarse en este tema e investigar el efecto de la combinación de amoxicilina y ácido clavulánico (AMC) sobre la MI bacteriana y fúngica de ratones y lactantes.

Reducción imprevista y dependiente de los antibióticos en la carga fúngica intestinal 

Su estudio en ratones convencionales demostró, como era de esperar, que la AMC administrada durante 10 días disminuía la cantidad de bacterias presentes en las heces y el intestino. Sin embargo, el tratamiento también redujo considerablemente la población fúngica global con respecto a los controles, lo cual era mucho más sorprendente. Un «cóctel» de antibióticos de amplio espectro (ampicilina, metronidazol, neomicina, vancomicina [VA]…) produjo el mismo efecto. En cambio, la respuesta al tratamiento de la micobiota de ratones que habían recibido un trasplante de microbiota fecal (TMF) de una persona adulta sana dependió del antibiótico administrado: la carga fúngica disminuyó con AMC, pero aumentó con VA. Paralelamente, los investigadores analizaron 19 muestras de MI de 7 lactantes de 2 a 4 meses tratados con amoxicilina (AMX) por una otitis media; este antibiótico, muy similar a la AMC, también redujo la carga bacteriana y fúngica entre el inicio y el final del tratamiento.

La combinación de amoxicilina y ácido clavulánico altera el equilibrio bacteriano y fúngico

Los investigadores observaron una disminución de la diversidad alfa y beta de la población fúngica en las heces de ratones convencionales tratados con AMC, pese a un aumento de Aspergillus, Cladosporium y Valsa con respecto a los ratones no tratados. Si bien la diversidad alfa bacteriana también estaba reducida, un análisis diferencial reveló una remodelación de las familias bacterianas presentes en la MI después del tratamiento, con un aumento de Enterobacteriaceae.

Con la sospecha de una relación entre el aumento de esta familia de bacterias y la reducción de la carga fúngica, los investigadores incubaron con S. cerevisiae 13 aislados bacterianos procedentes de las heces de ratones tratados con AMC: 9 inhibieron el crecimiento de la levadura, todos de la familia Enterobacteriaceae. Estas Enterobacteriaceae, en especial E. hormaechei, también redujeron el crecimiento de Candida albicans. Además, en los ratones que habían recibido un trasplante de microbiota fecal (TMF) humana, la colistina, que ataca a la familia Enterobacteriaceae, produjo un aumento de la carga fúngica intestinal. Después de otras pruebas in vitro e in vivo que les permitieron observar las interacciones entre bacterias y hongos intestinales, los investigadores concluyeron que la familia Enterobacteriaceae era, al menos en parte, responsable de la disbiosis de la micobiota intestinal generada por la AMC. Varios mecanismos podrían estar implicados, en especial una competición entre estas bacterias y los hongos por ciertos nutrientes.

¿El final de un paradigma?

Aunque se haya realizado con ratones y una pequeña cohorte de lactantes, este estudio pone en tela de juicio una idea muy arraigada: no todos los antibióticos favorecen la proliferación de hongos en la MI. La combinación de amoxicilina y ácido clavulánico, un antibiótico ampliamente prescrito, reduce la abundancia total de la población fúngica intestinal y remodela a la vez la composición de la MI entre especies de hongos y bacterias. Este estudio también muestra las estrechas relaciones que mantienen las comunidades bacterianas con los hongos de la microbiota intestinal mediante las alteraciones complejas que pueden producir los antibióticos sobre el equilibrio de sus poblaciones. La confirmación de estos resultados en cohortes más grandes podría conducir a adaptar la práctica médica, en especial en situaciones en las que la micobiota desempeñe un papel importante para la salud del paciente.