Может ли состав микробиоты ротоглотки быть предиктором смертности от COVID-19?

Теперь не потребуется сортировка пациентов с Covid-19, поступающих в стационар, по возрасту или массе тела. Численность двух видов бактерий микробиоты ротоглотки является надежным показателем, и в будущем ее измерение может стать золотым стандартом. Так считают специалисты из Германии: они убеждены, что микробиота ротоглотки играет важнейшую роль в регулировании человеческого иммунитета, гомеостазе слизистых оболочек и защите организма от возбудителей. Стоит отметить, что предыдущие исследования оказались значительно менее убедительными. Скорее всего, это связано с тем, что в большинстве из них участвовали пациенты с тяжелой формой Covid-19, у которых были многочисленные сопутствующие факторы (антибиотикотерапия, инвазивная искусственная механическая вентиляция и т.д.). Эти факторы могли изменить количественный и качественный состав микробиоты.

Антибиотики и искусственная вентиляция нарушают микробиоту ротоглотки 

В многоцентровом клиническом исследовании (7 центров в Германии) брали мазки из ротоглотки у 72 здоровых взрослых добровольцев, 112 пациентов с инфекциями, не связанными с атипичным вирусом SARS-CoV-2 (инфекции верхних дыхательных путей легкой степени или тяжелая пневмония), и пациентов с легкой, умеренной или тяжелой формой COVID-19 (36, 37 и 65 человек соответственно). В исследовании приняли участие 322 человека в возрасте от 21 до 93 лет.

Ученые выяснили, что терапия антибиотиками широкого спектра действия и инвазивная искусственная вентиляция дестабилизируют микробиоту ротоглотки: у пациентов с COVID-19 умеренной или тяжелой степени выявлено сокращение качественного состава и тяжелый дисбиоз во время длительной госпитализации.

Два вида бактерий как возможные предикторы смертности

Самым важным открытием, полученным с использованием моделей искусственного интеллекта (машинного обучения), стало обнаружение в образцах, собранных сразу после поступления (в которых отсутствуют изменения, вызванные лечением), сигнатуры, свидетельствующей о повышении риска смерти от Covid-19. Снижение численности двух родов бактерий — Neisseria (точнее, вида Neisseria subflava) и Haemophilus (виды Haemophilus influenzeae, parainfluenzae и pittmaniae) — сопровождается значительным повышением риска смерти. Эта прогностическая модель надежнее, чем модели, основанные на клинических показателях, таких как возраст, половая принадлежность или наличие ожирения. Лежащие в основе этого феномена механизмы пока не объяснены, но возможно, что эти бактерии регулируют врожденный иммунный ответ и выработку цитокинов.