¿Influye la leche materna en el «resistoma» del bebé?

Las recomendaciones sobre la lactancia materna se han basado durante mucho tiempo en opciones binarias: lactancia materna frente a leche de fórmula. Un estudio de referencia publicado en Nature Communications por Ferretti, Allert et al. desmonta por completo esa visión simplista ¹.

Mediante el uso de metagenómica de tipo «shotgun» (sidenote: Secuenciación metagenómica indiscriminada Se trata de un método de secuenciación de alta resolución en el que se analiza todo el material genético de cada microorganismo presente en una muestra. Al contrario que otras técnicas anteriores en las que solo se identificaban las familias de las bacterias, permite una identificación precisa hasta el nivel taxonómico de las especies y revela los genes funcionales de esas bacterias. )  en 507 muestras de 195 parejas de madres e hijos, el equipo identificó las bacterias no solo a nivel de especie, sino también a nivel de cepa; es decir, con la resolución genética necesaria para demostrar la transmisión, y no solo para deducirla. Sus hallazgos replantean la lactancia materna como una intervención microbiana activa y específica de cada cepa, con consecuencias cuantificables para el resistoma (sidenote: Resistoma El conjunto completo de genes de resistencia a los antimicrobianos (ARG) presentes en un microbioma. En este estudio, la leche materna influyó de manera significativa en el resistoma intestinal de los lactantes, incluso en aquellos que nunca habían recibido antibióticos. ) .

Cuando una especie mantiene unido el microbioma

La Bifidobacterium longum estaba presente en el 98,2 % de las muestras de heces de los lactantes al mes de edad, pero la prevalencia por sí sola subestima su papel. Los lactantes cuyo intestino estaba dominado por la B. longum, y en particular por su subespecie B. longum subsp. infantis, mantuvieron una composición del microbioma significativamente más estable entre el primer y el sexto mes que aquellos en los que predominaban otras especies.
El mecanismo es específico: B. longum subsp. infantis posee la maquinaria enzimática necesaria para degradar los oligosacáridos de la leche materna (HMO), lo que le confiere una ventaja competitiva decisiva en el intestino de los lactantes alimentados con leche materna.
Su abundancia relativa media se disparó del 3,2 % al mes de edad al 23,8 % a los seis meses. Los lactantes con intestinos no dominados por bifidobacterias mostraron la mayor volatilidad.

Doce transmisiones confirmadas y lo que revelan sobre el eje intestino-leche

Se han identificado doce casos de coincidencia a nivel de cepa entre la leche materna y la flora intestinal del lactante; se trata de la misma especie y de una huella genética idéntica, lo que demuestra que la leche materna es una vía de transmisión auténtica.
Los taxones compartidos abarcaban comensales (B. longum, B. bifidum), especies asociadas al intestino (Phocaeicola vulgatus) y residentes orales típicos como Streptococcus salivarius y Rothia mucilaginosa; estas dos últimas sugieren una colonización retrógrada desde la cavidad oral del lactante hacia la leche durante la lactancia, un eje bidireccional biológicamente plausible.

Lo más destacable fue la detección de Klebsiella pneumoniae como cepa compartida confirmada. Ningún lactante presentó manifestaciones clínicas, lo que concuerda con un portador comensal asintomático; no obstante, este hallazgo indica que la vigilancia de la leche a nivel de cepa, sin necesidad de cultivos, podría aportar una estratificación del riesgo significativa en entornos neonatales de alto riesgo, más allá de lo que pueden ofrecer los cribados estándar mediante cultivos.

El modo de parto agrava aún más esta situación: el 19,4 % de las cepas intestinales de los bebés a la edad de un mes persistían a los seis meses, y los bebés nacidos por vía vaginal conservaban un número significativamente mayor de ellas que los nacidos por cesárea (p = 0,018), lo que demuestra que el modo de parto no solo influye en la colonización temprana, sino también en la estabilidad de la comunidad microbiana durante los primeros seis meses de vida.

El resistoma se hereda y la lactancia materna puede modularlo

Todos los lactantes presentaban genes de resistencia a los antibióticos (ARG) al cumplir un mes de edad, incluido el 67 % que no tenía constancia de exposición a antibióticos antes, durante o después del nacimiento. Se observaron clases de resistencia a la tetraciclina, a los MLS (macrólidos, lincosamidas y estreptograminas), a los aminoglucósidos y a los betalactámicos. Esto no es un indicio de fracaso clínico, sino que corresponde a la ecología basal del intestino neonatal humano, constituida a través de mecanismos independientes de la presión selectiva de los antibióticos y en gran medida invisibles para los exámenes clínicos estándar.

Lo que aporta este estudio es el eje de transmisión y, lo que es más importante, una medida de control modificable. Los pares de madre e hijo compartían un número significativamente mayor de genes de resistencia a los antibióticos (ARG) que los pseudopares permutados (p < 0,016). Los genes compartidos dominantes fueron MACB (clase MLS), ACRD (aminoglucósido) y TETQ (tetraciclina). El intercambio fue mayor en las dos parejas con casos confirmados de transmisión de cepas, lo que proporciona una explicación coherente desde el punto de vista mecánico. Sin embargo, los lactantes con intestinos dominados por bifidobacterias portaban un número notablemente menor de ARG que aquellos dominados por otras especies (p = 7,6 × 10^(−10)).

Las implicaciones para la práctica clínica son evidentes: favorecer la colonización por Bifidobacterium mediante la lactancia materna exclusiva y, cuando esté indicado, el uso de probióticos que contengan B. longum subsp. infantis, no solo enriquece la microbiota, sino que también inhibe el resistoma.