Les probiotiques : de quoi parle-t-on ?

Probiotiques

Du latin pro et du grec bios signifiant « pour la vie », le terme « probiotique » a été proposé il y a plus de 60 ans en opposition à « antibiotique » ¹ . Par leurs bénéfices sur l’homéostasie du microbiote et la santé de l’hôte, les micro-organismes probiotiques suscitent un vif intérêt auprès des chercheurs, cliniciens et patients. Quoique bien définis et encadrés, les probiotiques n’ont pas encore livré tous leurs secrets. Mise au point.

A propos de cet article

Publié le 12 octobre 2023

Mis à jour le 08 novembre 2023

Sommaire

Chapitres

Définition et petite histoire moderne des probiotiques

Les probiotiques sont « des micro-organismes vivants qui, lorsqu'ils sont administrés en quantités suffisantes, confèrent un bénéfice pour la santé de l'hôte ». La première définition de l’Organisation pour l'alimentation et l'agriculture (FAO) et de l’Organisation Mondiale pour la Santé (OMS) en 2002 ²a été légèrement reformulée par un consensus d’experts en 2014 ³.

Dès l’Antiquité, des avantages nutritionnels et thérapeutiques ont été attribués aux aliments fermentés. Mais ce n’est qu’à partir de 1906, suite aux travaux de Louis Pasteur, que les effets sur la santé de micro-organismes liés à la fermentation lactique ont été scientifiquement explorés ². Ainsi le russe Elie Metchnikoff a associé la longévité des ruraux bulgares à la consommation régulière de lait fermenté - par le Bacillus bulgaricus ¹. Le pédiatre Henri Tissier, constatant la pauvreté des selles des enfants diarrhéiques en bactéries « bifides », suggérait que celles-ci pourraient restaurer leur flore intestinale ². Le « boom » de la science des probiotiques se produira à partir de la fin des années 80 ⁴, avec la biologie moléculaire. Depuis, des progrès cruciaux ont été réalisés dans la caractérisation des micro-organismes probiotiques et la démonstration de leurs bénéfices sur la santé ^4,5 .

Microbiote, probiotique, microbiome : si proches et pourtant si différents

Un microbiote décrit l'ensemble des micro-organismes vivant dans un environnement spécifique ⁶. L’organisme humain abrite un microbiote intestinal, qui contient 10¹² à 10¹⁴ micro-organismes ⁷ , mais aussi cutané, vaginal, oral, nasopharyngé et pulmonaire ^7,8. Bien que certains micro-organismes du microbiote intestinal soient une source de probiotiques potentiels ⁵, ils ne peuvent être appelés « probiotiques » tant qu’ils n’ont pas été isolés, caractérisés, et leur effet sur la santé démontré cliniquement ³.

Les termes « microbiote » et « microbiome » sont souvent confondus mais pas synonymes. Le premier décrit les différents micro-organismes présents dans le milieu étudié d’un point de vue taxonomique : genres, espèces… Le second définit le génome de ces micro-organismes ⁶, voire d’autres éléments structuraux internes ou externes (ARN, molécules signal, environnement…) dans l’objectif de mieux comprendre leur activité et leurs fonctions ⁹ .

Zoom sur les microorganismes : lesquels sont probiotiques ?

Pour rappel, les micro-organismes sont des êtres vivants invisibles à l’œil nu comprenant ¹⁰:

Tous les organismes unicellulaires procaryotes (une seule cellule sans noyau) : On y trouve les bactéries, dont les nombreuses espèces vivent dans tous les milieux, y compris le corps humain ^10,11 , mais aussi les archées : résistantes dans des conditions extrêmes, elles feraient partie des premières formes de vie sur terre ^12,13 .
Certains micro-organismes uni- ou pluricellulaires eucaryotes (une ou plusieurs cellules avec noyau) : On compte parmi eux les champignons microscopiques, dont les levures ou les moisissures ¹⁴ , mais aussi les microalgues et les protozoaires ^15,16 .
Les virus : Leur appartenance au domaine du vivant reste débattue : ce ne sont pas des cellules et ils ne peuvent se répliquer que dans une cellule hôte ^10,17 .

Les micro-organismes les plus utilisés comme probiotiques sont :

Les bactéries lactiques, avec les genres Lactobacillus, Bifidobacterium mais aussi Lactococcus, Streptococcus et Enterococcus ^5,18.
Plus rarement, d’autres bactéries comme Clostridium et Escherichia Coli ¹⁹.
Les levures comme Saccharomyces boulardii, issue de la peau des litchis et mangoustans ²⁰, ou encore Kluveromyces ²¹ .

Les probiotiques sont désignés selon une nomenclature internationale par leur genre, leur espèce (parfois en plus leur sous-espèce) et leur numéro de souche ²². Par exemple : Lactobacillus (genre) casei (espèce), puis une suite de chiffres et/ou de lettres (souche). Une souche se distingue des autres micro-organismes d’une même espèce car elle est génétiquement unique et possède des propriétés physiologiques spécifiques ¹⁸.

Qualification ‘probiotique’ : attention aux confusions

Les mésusages du terme probiotique sont courants. Certains produits tels que des shampooings, des désinfectants ou des après-rasages l’affichent sans que les critères requis ne soient démontrés en termes d'efficacité et de viabilité ³.

Les aliments fermentés sont « élaborés avec une croissance microbienne et une conversion enzymatique souhaitée de composants alimentaires ». Certains aliments fermentés, comme des yogourts, contiennent des micro-organismes vivants. Mais ceux-ci doivent avoir démontré des bénéfices nutritionnels au-delà de la matrice alimentaire pour être qualifiés de probiotiques ²³ .

Les prébiotiques sont des substrats, notamment des fibres alimentaires (fructo-oligosaccharides, inuline…), utilisés par les micro-organismes d’un microbiote et favorisant leur croissance, conférant ainsi un bénéfice pour l’hôte ^24,25 . Les produits contenant à la fois pré- et probiotiques sont dits symbiotiques ²⁴.

La transplantation de microbiote fécal (TMF) consiste en l’introduction de selles d’un donneur sain dans le tractus digestif d’un patient receveur dans le but de traiter des maladies en lien avec une dysbiose. L’ensemble des micro-organismes transplantés n’étant pas identifiés, la préparation de TMF n’entre pas dans le cadre des probiotiques ³. A ce jour uniquement elle est indiquée dans le traitement des infections récidivantes à C. difficile ²⁶.

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Bénéfices santé des probiotiques

L’efficacité de souches spécifiques de probiotiques a été cliniquement démontrée dans différentes sphères.

Sphère digestive

prévention de la diarrhée associée aux antibiotiques (DAA) chez l’enfant ²⁷, diarrhées à C. difficile ²⁸, gastro-entérites aigues de l’enfant ²⁹, troubles fonctionnels intestinaux ³⁰, intolérance au lactose ³¹, maladies inflammatoires chroniques de l’intestin (MICI) ³², prévention de l’entérocolite ulcéro-nécrosante du prématuré ³³, infection à H. pylori ³⁴, infections et diarrhées de la nutrition parentérale ³⁵ , prévention de la diarrhée du voyageur ³⁶ …

Autres sphères

infections hivernales respiratoires ³⁷ , infections urinaires récidivantes ³⁸ , infections gynécologiques ³⁹ , dermatite atopique de l’enfant ⁴⁰ , allergies alimentaires ⁴¹ …

D’autres effets bénéfiques sont en cours d’étude

notamment l’influence des probiotiques sur l’hypercholestérolémie ⁴² , le cancer colorectal ⁴³ ou certains troubles neuropsychiatriques ⁴⁴.

Un mode d’action pour chaque souche

Un probiotique exerce un effet bénéfique sur le microbiote en le maintenant à l’équilibre, en favorisant sa reconstruction pendant et après un épisode de dysbiose ou en prévenant certaines situations cliniques de rupture de l’écosystème microbien ⁴⁵ . Le mode d’action est souche-dépendant, dans la plupart des cas non extrapolable à l’espèce ou au genre ⁴⁶.

Chaque probiotique agit suivant ses propriétés physiologiques et pharmacologiques propres, et/ou sur ^46,47 :

L’hôte

par modulation du système immunitaire, action anti-inflammatoire, effet trophique sur les tissus, stimulation du capital enzymatique et/ou renforcement de l’effet barrière contre les pathogènes ;

Les pathogènes

par libération de molécules antimicrobiennes contre les champignons, les bactéries ou les virus ;

Les toxines

par neutralisation des toxines pathogènes.

Les sociétés savantes telles que la World Gastroenterology Organisation (WGO), l’European Society for Paediatric Gastroenterology Hepatology and Nutrition (ESPGHAN), et The International Scientific Association of Probiotics and Prebiotics (ISAPP) émettent régulièrement des opinions et recommandations sur l’utilisation des probiotiques.

N’est pas probiotique qui veut : 4 grandes conditions

Quatre critères inspirés de la définition donnée par l’OMS/FAO ² permettent de déterminer si des micro-organismes peuvent être qualifiés de probiotiques ^22,47:

Être suffisamment caractérisés (genre, espèce et souche) par des tests phénotypiques et caractérisation génétiques Aujourd’hui, le séquençage génomique de la souche est également préconisé, notamment pour l’évaluation de l’innocuité ;
Ne pas présenter de toxicité pour l'usage prévu, telle que production de toxine, potentiel hémolytique ou pouvoir infectieux sur modèle animal ;
Avoir une action positive sur l’homme soutenue par au moins un essai clinique chez l’homme mené conformément aux normes scientifiques acceptées ou aux recommandations et dispositions des autorités de santé ;
Être vivant dans le produit et à une dose efficace pendant toute la durée de sa conservation.

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BMI-21.24

Sources

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