A microbiota na pandemia da covid-19

Covid-19

Síntese

^{Pelo Pr. Conceição Calhau

NOVA Medical School, Universidade Nova de Lisboa, Portugal

Pelo Pr. Pedro Povoa

NOVA Medical School, Universidade Nova de Lisboa, Portugal; Unidade de Cuidados Intensivos Polivalente, Hospital de São Francisco Xavier, CHLO, Lisboa, Portugal; Centro de Epidemiologia Clínica, OUH Odense, Hospital Universitário, Dinamarca}

Sobre este artigo

Publicado em 26 Julho 2022

Atualizado em 26 Julho 2022

Pela primeira vez, a diversidade da microbiota intestinal é apontada como um biomarcador prognóstico da gravidade da Covid-19. Assim, as alterações da microbiota como biomarcadores fiáveis no contexto da Covid-19 representa uma peça chave do puzzle da doença, destacando assim a prioridade clínica para a prevenção e possivelmente novas estratégias terapêuticas. Em 2020, o novo coronavírus afetou gravemente determinados grupos da população, mais especificamente, os idosos e as pessoas com obesidade, hipertensão, diabetes [1]. Curiosamente, as publicações mostraram que a disbiose é um fator comum em todos estes doentes [2, 3].

ASSINATURAS DE MICROBIOTA INTESTINAL EM DOENTES COM COVID-19

Como a microbiota intestinal tem sido considerada um tema quente na comunidade científica com um papel central nas funções imunitárias e inflamatórias do hospedeiro, investigámos se alterações na composição da microbiota intestinal estão associadas a uma maior gravidade clínica da Covid-19 [4]. Foi realizado um estudo multicêntrico nacional transversal em 115 doentes com Covid-19 categorizados por: 1) local de recuperação da Covid-19: ambulatório (isolamento doméstico), enfermaria ou unidade de cuidados intensivos; e 2) escala de gravidade da Covid-19: assintomática/moderada ou grave. Os doentes gravemente doentes apresentaram alterações profundas na composição da microbiota intestinal, em comparação com os doentes ligeiros a moderados em ambulatório ou internados na enfermaria do hospital (Figura 1). Estas alterações incluíram: 1) menor diversidade microbiana intestinal global; 2) menor abundância de bactérias produtoras de butirato benéficas, como Roseburia e Lachnospira; 3) menor relação Firmicutes/Bacteroidetes; 4) maior abundância de Proteobactérias. Além disso, detetámos o vírus em amostras fecais, o que deve ser considerado nas recomendações de saúde pública [5, 6] Publicações de outros colegas mostraram que a baixa diversidade pode ser um biomarcador clínico que prevê um maior risco de gravidade [7-9].

Microbiota respiratória em doentes críticos com covid-19

A sabedoria convencional era que os pulmões saudáveis eram estéreis. Na última década, a aplicação de técnicas de investigação de microbiota mostrou claramente que não era esse o caso. Os pulmões são colonizados por uma carga bacteriana muito baixa em comparação com o intestino [10]. As diferentes partes do trato respiratório (orofaringe, vias respiratórias, pulmões) apresentam diferentes diversidades e composições relacionadas com as fontes de colonização, taxas de colonização, taxas de extinção e distâncias entre si, de acordo com o modelo adaptado da ilha, sendo o «continente» a cavidade oral [11]. Estudos recentes em doentes com Covid-19 grave mostraram disbiose da microbiota das vias aéreas (analisada em amostras de BALF) semelhante à disbiose observada durante infeções do trato respiratório inferior, pneumonia, por exemplo [12, 13]. Além disso, Acinetobacter – um agente patogénico gram-negativo comum de bacilos não fermentadores da pneumonia associada à ventilação mecânica, que é a infeção mais grave adquirida na UCI em doentes submetidos a ventilação mecânica invasiva – foi um género bacteriano comum encontrado nos tecidos pulmonares em doentes falecidos [14]. A presença de alguns agentes patogénicos no pulmão de doentes falecidos e na cavidade oral está relacionada com a migração do modelo de ilha adaptada. [15] Em resultado da desregulação imunitária associada à Covid- 19, vários estudos epidemiológicos mostraram um risco acrescido de infeções hospitalares adquiridas, nomeadamente pneumonia associada à ventilação mecânica, como o nosso grupo demonstrou. No nosso estudo descobrimos que os doentes com Covid-19 apresentaram o dobro do risco de pneumonia associada à ventilação mecânica em comparação com os doentes não Covid 19 [16].

Conclusão

Os estudos de microbiota e Covid-19 podem abrir perspetivas para o desenvolvimento de intervenções terapêuticas (probióticos, prebióticos...) que visam corrigir a disbiose observada em doentes graves com Covid-19. Espera-se que estas intervenções aumentem a diversidade bacteriana global e a abundância de bactérias comensais, contribuindo assim para inibir o crescimento excessivo de agentes patogénicos oportunistas. Estes estudos poderão também ter implicações na conceção de vacinas eficazes contra a Covid 19, pois um fator conhecido para controlar a eficácia da vacina poderá ser a microbiota intestinal.

Fontes

^{1 Petrakis D, Margină D, Tsarouhas K, et al. Obesity ‑ a risk factor for increased COVID‑19 prevalence, severity and lethality. Mol Med Rep 2020; 22: 9-19.}

^{2 Finlay BB. Are noncommunicable diseases communicable? Science 2020; 367: 250-1.}

^{3 Leocádio PCL, Oriá RB, Crespo-Lopez ME. Obesity: More Than an Inflammatory, an Infectious Disease? Front Immunol 2019; 10: 3092.}

^{4 Moreira-Rosário A, Marques C, Pinheiro H, et al. Gut microbiota diversity and c-reactive protein are predictors of disease severity in COVID-19 patients. Front Microbiol 2021; 12: 705020.}

^{5 Guo M, Tao W, Flavell RA, et al. Potential intestinal infection and faecal-oral transmission of SARS-CoV-2. Nat Rev Gastroenterol Hepatol 2021; 18: 269-83.}

^{6 Wu Y, Guo C, Tang L, et al. Prolonged presence of SARS-CoV-2 viral RNA in faecal samples. Lancet Gastroenterol Hepatol 2020; 5: 434-5.}

^{7 Gu S, Chen Y, Wu Z, et al. Alterations of the gut microbiota in patients with coronavirus disease 2019 or H1N1 influenza. Clin Infect Dis 2020; 71: 2669-78.}

^{8 Yeoh YK, Zuo T, Lui GC-Y, et al. Gut microbiota composition reflects disease severity and dysfunctional immune responses in patients with COVID-19. Gut 2021 70, 698–706.}

^{9 Zuo T, Liu Q, Zhang F, et al. Depicting SARS-CoV-2 faecal viral activity in association with gut microbiota composition in patients with COVID-19. Gut 2021; 70: 276-84.}

^{10 Roux D, van Oort PM, Ricard JD, et al. Airway microbiome research: a modern perspective on surveillance cultures? Ann Transl Med 2017; 5: 445.}

^{11 Whiteson KL, Bailey B, Bergkessel M, et al. The upper respiratory tract as a microbial source for pulmonary infections in cystic fibrosis. Parallels from island biogeography. Am J Respir Crit Care Med 2014; 189: 1309-15.}