МИКРОБИОМ НА GASTRO 2021

В 2020 году Всемирный день здоровья пищеварительной системы, проводимый при поддержке WGO, был посвящен «Глобальным вопросам в области микробиома». Профессор Куигли от имени многих коллег, которые внесли свой вклад в эту программу, представил работу, посвященную микробиому кишечника. Были определены факторы, влияющие на микробиом и определяющие его развитие в течение критического и уязвимого периода с рождения до раннего детства, а также установлена важная роль характера питания на протяжении всей жизни человека. Несмотря на предположения о роли микробиома в развитии целого ряда заболеваний, многие исследования носят описательный характер и не рассматривают причинно-следственные связи.

Одним из заболеваний, при котором роль микробиома вызывает наибольший интерес, — это синдром раздраженного кишечника (СРК). Мирьяна Раджилич-Стоянович подробно изучила аспекты заболевания и выделила факторы, осложняющие интерпретацию результатов исследований микробиома при СРК (например, малые размеры исследуемых популяций, гетерогенность фенотипов, вариабельный дизайн исследований), что мешает достоверному определению микробных сигнатур у пациентов с СРК. Она выделила два микроорганизма, которые могут представлять особый интерес: Methanobrevibacter smithii и Faecalibacterium prausnitzii. Первый интересен своей способностью производить метан, а второй — благодаря своей роли в передаче сигналов к энтерохромаффинным к л е т к а м , с п о с о б с т в у е т п о в ы ш е н и ю образования серотонина — важнейшего нейротрансмиттера энтеральной нервной с и с т е м ы и м и ш е н ь д л я б о л ь ш и н с т в а препаратов, применяемых при СРК.

ТРАНСПЛАНТАЦИЯ ФЕКАЛЬНОЙ МИКРОБИОТЫ

М и к р о б и о м о б л а д а е т о г р о м н ы м терапевтическим потенциалом. Франсиско Г в а р н е р о б н о в и л р у к о в о д с т в о W G O п о п р о б и о т и к а м , а П а в е л Д р а с т и ч в н ё с и з м е н е н и я в а к т у а л ь н у ю т е м у трансплантации фекальной микробиоты (ТФМ). Он сравнил результаты применения Т ФМ п р и з а б о л е в а н и и , в ы з ы в а е м о м Clostridioides difficile, с данными по другим состояниям. Больше всего данных накоплено по ТФМ при язвенном колите (хотя их качество оценивается как умеренное). В данном случае интерпретация результатов затруднена теми же факторами, которые м е ш а ю т а н а л и з у и с с л е д о в а н и й Т Ф М : разнообразие исследуемых популяций, к о н е ч н ы х т о ч е к и п р о т о к о л о в . Ч т о касается последнего фактора, то это использование свежих или замороженных фекалий, способ введения (назоеюнальный, с помощью клизмы или колоноскопа, пероральный [в капсулах]), количество доз (одна или несколько), происхождение материала (один донор или объединенный м а т е р и а л о т н е с к о л ь к и х д о н о р о в ) . Впечатляют возможности дальнейшего р а з в и т и я м е т о д а Т Ф М : с о в р е м е н е м планируется переход от использования цельных образцов стула к специфическим к о м б и н а ц и я м м и к р о о р г а н и з м о в (широчайшие возможности для научной и коммерческой деятельности), а также создание биологически и терапевтически активных соединений непосредственно из микробиоты. Мирьяна Раджилич-Стоянович рассказала о возможностях и ограничениях м е т о д а Т Ф М п р и С Р К . З д е с ь т а к ж е имеются вмешивающиеся факторы: крайне разнообразные проявления заболевания, различная степень тяжести симптомов и их динамика, неполное понимание роли микробиома и достаточно абстрактные представления о том, чего следует ожидать от ТФМ. Неудивительно, что результаты на сегодняшний день сильно разнятся.

ТЕКУЩЕЕ СОСТОЯНИЕ ИССЛЕДОВАНИЯ МИКРОБИОТЫ

Одно из вступительных заседаний Франсиско Гварнер посвятил текущему состоянию дел в области изучения микробиоты. Интересный и емкий доклад, особенно актуальный в контексте пандемии Covid-19 и глобальной проблемы антибиотикорезистентности, к а с а л с я в а ж н о с т и и з у ч е н и я м и к р о о р г а н и з м о в , н а с е л я ю щ и х н а ш у планету. Франсиско Гварнер напомнил слушателям о связи между плохим питанием и общей смертностью, подчеркнув, что низкое качество питания существенно снижает качество нашей микробиоты, приводя к ухудшению физического и эмоционального состояния. Низкое микробное разнообразие кишечника связано с рядом заболеваний, о д н и м и з к о т о р ы х я в л я е т с я д е т с к а я бронхиальная астма. Он отметил недостатки таксономического подхода к изучению микробиома, показав, что у здоровых людей микробиом кишечника находится в высокодинамическом равновесии — до 90% штаммов появляются и исчезают с течением времени. Поэтому он предложил другой подход к определению нормального и патологического микробиома (эубиоз или дисбиоз), где в первую очередь учитывается ф у н к ц и о н а л ь н а я к о м п е т е н т н о с т ь и экологическая стабильность (включая такие понятия, как устойчивость к структурным и з м е н е н и я м с о о б щ е с т в а с т е ч е н и е м в р е м е н и , с п о с о б н о с т ь в о з в р а щ а т ь с я в исходное состояние после повреждения, н а п р и м е р , а н т и б и о т и к о т е р а п и и ) . Э т а фундаментальная смена парадигмы отражает переход от простого подсчета количества микроорганизмов, их видов и штаммов к описанию функционального потенциала с использованием метагеномики и анализов п р о д у к т о в м е т а б о л и з м а с п о м о щ ь ю метаболомики и метатранскриптомики.