ВЗК: роль вирусов в составе кишечной микробиоты

Уменьшение численности и разнообразия бактерий кишечной микробиоты, вызванное воспалительными заболеваниями кишечника, связано со значительным изменением количества вирусов, уничтожающих бактерии (т.н. бактериофагов). До сих пор недостаточно изученные, эти вирусы могут играть важную роль в развитии ВЗК.

 

ВЗК или хронические воспалительные заболевания кишечника, в частности болезнь Крона и язвенный колит, представляют собой группу хронических заболеваний с чередующимися фазами обострения и ремиссии. Они связаны с изменениями в микробиоте кишечника, включающими уменьшение бактериального разнообразия и сокращение численности некоторых видов бактерий. Однако, все больше и больше исследований подтверждают идею одновременного изменения популяции вирусов, которая также обнаруживается в кишечнике, в форме изменения их разнообразия и увеличения количества вредоносных вирусов.

Количество «вирусов-убийц»

Чтобы идентифицировать вирусы, вовлеченные в развитие ВЗК, международная группа исследователей изучала микробиоту кишечника пациентов с болезнью Крона и язвенным колитом во время обострения и ремиссии, а также кишечную микробиоту здоровых субъектов контрольной группы. Результаты показывают, что у 70% людей контрольной группы определяются две основные группы вирусов, образующие «вирусное ядро», которое отсутствует во время болезни. Его заменяет множество умеренных бактериофагов, грозных вирусов, которые уничтожают полезные бактерии, что может объяснить более низкое бактериальное разнообразие, наблюдаемое в микробиоте кишечника пациентов. Авторы также обнаружили различия между двумя заболеваниями. Например, изменения в вирусном и бактериальном составе кишечной микробиоты более выражены у пациентов с болезнью Крона; у пациентов с язвенным колитом отмечается очень мало различий в составе микробиоты между обострениями заболевания и фазами ремиссии; четкое объяснение, почему это происходит, отсутствует.

Новый подход

Комплексный анализ бактерий и вирусов в микробиоте кишечника помогает нам понять изменения, связанные с воспалительными заболеваниями кишечника. Этот подход может в конечном итоге привести к разработке биомаркеров, полезных для диагностики и разработки новых терапевтических стратегий.

 

Источники :

Clooney A.G. et al. Whole-virome analysis sheds light on viral dark matter in inflammatory bowel disease. Cell Host & Microbe. 2019 ; https://doi.org/10.1016/j.chom.2019.10.009