Microbiota intratumoral: ¿un indicador pronóstico independiente en el cáncer colorrectal?
Un estudio de cohorte prospectivo que incluyó a 937 pacientes sugiere que existe una correlación entre el pronóstico y la microbiota de los tejidos tumorales en el cáncer colorrectal, independientemente de los factores clínico-moleculares ya conocidos.
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Acerca de este artículo
El cáncer colorrectal constituye la segunda causa de muerte por cáncer en el mundo.
9,3 % Representa el 9,3% de la mortalidad total por cáncer ¹.
47 582 En Francia, en 2023 se diagnosticaron 47 582 nuevos casos, de los cuales el 95% se detectó en personas mayores de 50 años, con una distribución del 55% en hombres y el 45% en mujeres ².
Metodología de referencia: la secuenciación de nueva generación (NGS) en 937 pacientes
Shi y cols. 3 analizaron datos derivados de la secuenciación del genoma completo de 1 412 tejidos:
- 937 tumores y 475 tejidos adyacentes normales (TAN)
- y 462 muestras de sangre de 937 pacientes sin tratamiento previo, reclutados en la cohorte prospectiva U-CAN (Uppsala-Umeå, Suecia).
Para la validación se utilizó una cohorte externa independiente (AC-ICAM, n = 246). Se desarrolló un riguroso pipeline bioinformático para detectar y cuantificar las bacterias presentes en los tejidos tumorales. En el diseño, la especificidad prevaleció sobre la sensibilidad, respondiendo así a las recientes controversias metodológicas en este campo.
Subtipos moleculares en el CCR (CMS1-4)
El cáncer colorrectal no constituye un grupo homogéneo. Según la clasificación internacional CMS (Consensus Molecular Subtypes), cabe distinguir cuatro subtipos en función del perfil molecular tumoral 4.
Esta clasificación es fundamental para interpretar los resultados de Shi y cols.
Características:
- tumores hipermutados,
- reacción inmunitaria intensa,
- colon derecho.
Asociación microbiana según el estudio de Shi y cols., 2025: aumento de la abundancia relativa de ciertas subespecies de Fusobacterium (Fn. animalis C2, Fn. nucleatum, Fn. vincentii y Fn. polymorphum), y de ciertas bacterias orales (Parvimonas, Peptostreptococcus, Treponema) en comparación con los otros subtipos. Ninguna asociación pronóstica pks+ específica de este subtipo.
Características:
- subtipo más frecuente (37%),
- activación de las vías WNT y MYC.
Asociación microbiana según el estudio de Shi y cols., 2025: asociación pronóstica específica pks+/Enterobacteriaceae → pronóstico desfavorable.
Características:
- anomalías metabólicas,
- mutación KRAS frecuente.
Asociación microbiana según el estudio de Shi y cols., 2025: asociación pronóstica específica pks+/Enterobacteriaceae → pronóstico desfavorable.
Características:
- transformación mesenquimatosa,
- riesgo metastásico elevado.
Asociación microbiana según el estudio de Shi y cols., 2025: asociación pronóstica con un aumento de la abundancia relativa de Fn. animalis C2, Fn. nucleatum y Fn. Polymorphum, supervivencia reducida, mediante vías inmunometabólicas específicas.
La asociación pronóstica pks+/Enterobacteriaceae es específica del subtipo CMS2; los subtipos CMS1 y CMS4 presentan perfiles microbianos distintos que carecen de esta especificidad pronóstica pks+.
361 especies identificadas: una puntuación de riesgo microbiano validada
Los autores identificaron 249 géneros y 361 especies bacterianas presentes en ambos tipos de tejidos (tumores y TAN), entre las cuales destacaban:
- Fusobacterium nucleatum,
- diversas bacterias de la familia Enterobacteriaceae (E. coli),
- Akkermansia muciniphila,
- especies del filo Firmicutes y especies del género Treponema.
Se observó una gran variabilidad en los perfiles microbianos según la localización anatómica, el estadio tumoral y los subtipos moleculares de consenso (CMS1-4).
El 17,4% de los tumores resultaron positivos para el islote genómico pks, presente en ciertas cepas de E. coli genotóxicas que afectan a las células cancerosas colorrectales mediante la acción de la colibactina. En el subtipo CMS2, la presencia de pks+ y una gran abundancia de bacterias de la familia Enterobacteriaceae se asociaron específicamente con un pronóstico desfavorable.
La microbiota intestinal modula la respuesta tumoral en pacientes con cáncer
Asimismo, se elaboraron y validaron dos puntuaciones de riesgo microbiano —MRS-T (tumor) y MRS-N (TAN)— en las tres cohortes. Estas permiten predecir la supervivencia global independientemente de los factores clinicopatológicos convencionales, mejorando así la capacidad discriminatoria del modelo pronóstico en comparación con los factores del huésped por sí solos.
Por último, se observó una asociación entre los taxones desfavorables y la activación de vías proinflamatorias (hipoxia, MAPK1/3, IL-6) y una modulación del sistema inmunitario tumoral.
Implicaciones clínicas y limitaciones
La microbiota intratisular en el CCR constituye una fuente de información pronóstica independiente, potencialmente complementaria a los marcadores moleculares actuales. La especificidad de la asociación entre pks/Enterobacteriaceae y el subtipo CMS2 sugiere la necesidad de integrar la subtipificación molecular para una correcta interpretación del papel de la microbiota.
No obstante, es necesario considerar ciertas limitaciones:
- se trata de un diseño observacional
- centrado exclusivamente en pacientes sin tratamiento previo,
- y la secuenciación del genoma completo (WGS) no es, por el momento, una técnica aplicable en la práctica clínica habitual.
Antes de cualquier aplicación clínica, será preciso realizar ensayos mecanísticos y prospectivos.
1. PAHO-Bilan mondial du cancer.
2. Ameli-Cancer colorectal.
3. Shi Z. et al. Tissue-resident microbiota impacts colorectal cancer progression and prognosis. Nature Communications, 2026, 17:346. https://doi.org/10.1038/s41467-025-67047-2.
4. Guinney J. et al. The consensus molecular subtypes of colorectal cancer. Nature Medicine, 2015, 21(11), 1350–1356. https://doi.org/10.1038/nm.3967.
Véase también
