Predecir el riesgo de enterocolitis necrosante gracias al viroma intestinal

La enterocolitis necrosante (EN) es una complicación necroinflamatoria grave y repentina en los niños prematuros. Unos estudios anteriores sugieren la implicación de la microbiota intestinal en su aparición, mientras que otros apuntan a la posible implicación de ciertos virus. Ahora bien, el viroma intestinal de los niños prematuros se conocía mal hasta el momento.
De ahí los trabajos de un equipo estadounidense, que siguió la instauración del viroma de los prematuros a lo largo del tiempo para identificar los factores que pueden influir en el desarrollo de la EN.

Convergencia de los viromas 10 días antes de la enfermedad

En este estudio longitudinal metagenómico, se analizaron los viromas intestinales de 23 niños prematuros mediante secuenciación de nueva generación. Se hizo durante las 11 primeras semanas de vida, es decir, entre las 25 y las 36 semanas de edad posmenstrual (sidenote: Edad posmenstrual edad que corresponde al número de semanas de gestación al nacer más la edad posnatal. ) . Nueve de estos niños desarrollaron una EN a una edad posmenstrual media de unas 31 semanas; cuatro de ellos no sobrevivieron.

Los resultados muestran que el viroma intestinal de los niños prematuros presenta una fuerte variación inter e intraindividual en el tiempo. Esta constatación es idéntica tanto si los niños habían desarrollado una EN como si no. En cambio, se observa un resultado especialmente interesante: los viromas intestinales de los niños que desarrollaron una EN empezaron a converger en términos de diversidad beta (sidenote: diversidad β Una medida que indica la diversidad de especies entre las muestras, permite evaluar la variabilidad de la diversidad de la microbiota entre los sujetos. Hamady M, Lozupone C, Knight R. Fast UniFrac: facilitating high-throughput phylogenetic analyses of microbial communities including analysis of pyrosequencing and PhyloChip data. ISME J. 2010;4:17-27. https://www.nature.com/articles/ismej20099 ) 10 días antes de la aparición de la enfermedad. Una convergencia que se traduce en un enriquecimiento en virus específicos y en la pérdida de otros virus.
En lo referente a las bacterias, la diversidad beta bacteriana de estos niños se mantenía estable a lo largo de los 25 días anteriores a la EN. Sin embargo, en este periodo, la cantidad de Gammaproteobacteria, Bacilli, Enterococcaceae, Enterobacteriaceae y Veillonellaceae difería entre las muestras de los casos respecto a las de los controles. 

Identificar a los niños de riesgo

Por lo tanto, existen características virales asociadas a las interacciones virus-bacterias específicas que aparecen una decena de días antes de la aparición de la EN. Esto permite sugerir la implicación del viroma intestinal en los niños prematuros en la patogenia de esta complicación. Dado que la geografía es un factor que puede influir sobre el microbioma y el viroma, estos resultados obtenidos en un solo hospital de Estados Unidos deberán confirmarse en otras poblaciones. Sin embargo, permiten vislumbrar la posibilidad de identificar precozmente a los niños que presentan un mayor riesgo de desarrollar una EN.