Бесплодие встречается примерно у 10-15% пар, и в половине случаев причины кроются в наличии патологии у мужчин. Одним из факторов среды, влияющих на развитие данной патологии, является ожирение, которое приводит к снижению качества спермы. Чрезмерно богатая диета, вызывающая ожирение, также связана с изменением состава микробиоты кишечника (т.е. с дисбиозом (sidenote: Дисбиоз Изменение состава и функции микробиоты, вызванное сочетанием экологических и индивидуальных факторов. Дисбиоз не является четко очерченным состоянием и варьируется в зависимости от состояния здоровья каждого человека. Levy M, Kolodziejczyk AA, Thaiss CA, et al. Dysbiosis and the immune system. Nat Rev Immunol. 2017;17(4):219-232. ) ). Может ли экосистема кишечника быть ключевым фактором в развитии мужского бесплодия, связанного с нездоровой пищей?

Снижение числа сперматозоидов и их подвижности

Эта гипотеза была выдвинута китайскими исследователями. Чтобы оценить ее достоверность, они взяли четыре группы мышей: одна группа получала сбалансированный корм, а другая - корм с высоким содержанием жиров. Обе группы служили донорами для трансплантации фекальной микробиоты двум другим группам мышей, которые впоследствии получали нормальное питание. Неудивительно, что корм с высоким содержанием жиров (имитирующий «мусорную еду») приводил к увеличению массы тела, кроме того, у таких животных наблюдался дисбиоз и эндотоксемия (бактериальная инфекция, которая вызывает хроническое местное воспаление, способное нарушать сперматогенез). По данным анализа спермы мышей было установлено значительное снижение количества сперматозоидов и их подвижности. У мышей, которые нормально питались, но затем им была выполнена трансплантация фекальной микробиоты от представителей того же вида с ожирением, наблюдались схожие результаты, однако отсутствовало какое-либо увеличение массы тела или метаболические изменения. Считается, что дисбиоз и эндотоксемия вызывают воспаление кишечника и семенников, приводя к нарушению выработки и созревания сперматозоидов. Взаимосвязь между дисбиозом, эндотоксемией и низким качеством спермы также была подтверждена у бесплодных мужчин.

Нужно ли лечить дисбиоз для восстановления фертильности?

Авторы предполагают, что восстановление кишечной микробиоты может быть новым подходом к лечению проблем фертильности у мужчин, особенно с метаболическим синдромом.

Болезнь Крона (БК), воспалительное заболевание, которое может поражать любую часть пищеварительного тракта, все чаще встречается у детей. Как и все формы воспалительных заболеваний кишечника (ВЗК), она тесно связана с нарушениями состава микробиоты кишечника. Чтобы получить представление о составе микробиоты на ранних стадиях заболевания, исследовали образцы кала 64 детей, не получавших ранее лечения, и 18 здоровых контрольных субъектов.

Снижение разнообразия

Обилие (количество таксонов) и разнообразие (относительная распространенность) микробиоты у молодых пациентов с БК были ниже, чем у контрольных субъектов: отмечались значительные различия по 11 родам и 17 видам, с меньшим количеством актинобактерий и Firmicutes и более выраженным обилием энтерококков в группе пациентов с БК. Авторы также сообщают о значительном сокращении численности некоторых бутират-продуцирующих родов и видов, таких как Bifidobacterium adolescentis. Эти результаты соответствуют данным предыдущих исследований у детей и взрослых.

Локальное воспаление

Кроме того, при повышении уровня фекального кальпротектина (маркера воспаления) и активности заболевания наблюдается снижение численности ряда таксонов и разнообразия микробиоты, что позволяет предположить наличие связи между дисбиозом и воспалением желудочно-кишечного тракта. Хотя остается неясным, вызывает ли дисбиоз воспаление или сам является его следствием, авторы предполагают существование порочного круга с персистирующим воспалением, усиливающим дисбиоз, и наоборот. С другой стороны, отсутствие изменений в разнообразии микробиоты связано с биохимическими маркерами, такими как С-реактивный белок (СРБ), что позволяет предположить, что локальное воспаление в желудочно-кишечном тракте, отражаемое высоким уровнем кальпротектина, является более важным, чем системный воспалительный процесс.

На пути к таргетированному воздействию на микробиоту?

По мнению авторов, если дисбиоз кишечной микробиоты является одним из факторов риска развития и/или поддержания воспалительного процесса при ВЗК, то лечение, направленное на микробиоту (антибиотики, про- и пребиотики, трансплантация фекальной микробиоты), должно являться терапевтической целью. Кроме того, очевидны преимущества профилактического лечения на основе микробиоты для групп высокого риска. Наконец, отсутствие Fecalibacterium prausnitzii и B. adolescentis (или даже более низкое содержание Roseburia) в кале может служить биомаркером дисбиоза, который сигнализирует о болезни Крона.

Колоректальный рак (КРР) является одним из наиболее распространенных злокачественных новообразований во всем мире, и этот вид опухолей характеризуется высоким уровнем смертности. По-видимому, его развитие связано со сложными взаимодействиями между организмом хозяина и окружающей средой: стрессовые факторы, по-видимому, вызывают изменения ДНК клеток толстой кишки, участвующих в возникновении рака. Одним из факторов риска является дисбиоз (дисбактериоз) кишечника.

Результаты исследования на мышах ...

Группа ученых из Франции изучила изменения ДНК у 136 безмикробных мышей, которым при помощи трансплантации фекальной микробиоты (FMT) были введены образцы свежего кала 9 пациентов с КРР и 9 здоровых людей. Через семь недель после FMT у мышей, которым были введены образцы кала пациентов с КРР, наблюдалось легкое воспаление. В ходе обследования толстой кишки этих мышей через 7 и 14 недель было обнаружено больше предопухолевых изменений, известных как очаги аберрантных крипт, с более высоким количеством гиперметилированных генов. Была подтверждена взаимосвязь предопухолевых изменений с некоторыми видами бактерий (Firmicutes, Clostridia) и с уменьшением числа видов бактерий, известных своим противовоспалительным действием, а также продуцирующих бутират микроорганизмов.

... подтверждены у людей

Чтобы определить, было ли метилирование генов, наблюдавшееся у мышей, также связано с дисбиозом кишечника у людей, эта группа ученых проанализировала ткани, кровь и кал 18 пациентов с КРР и здоровых участников контрольной группы из первоначального эксперимента. Была подтверждена корреляция между составом микробиоты и уровнем эпигенетических изменений ДНК: здоровые добровольцы и пациенты с КРР отличались по уровню метилирования 3 генов.

Сразу после этого был разработан простой и воспроизводимый анализ крови, предназначенный для диагностики колоректальных опухолей на ранней стадии у бессимптомных пациентов на основании расчета кумулятивного индекса метилирования (CMI) определенных генов. Этот метод анализа успешно использовался в пилотном исследовании с участием 266 человек (специфичность (sidenote: специфичность способность обнаруживать только тех пациентов, у которых имеется данное заболевание (с наименьшим количеством ложноположительных результатов) ) - 95%, чувствительность (sidenote: чувствительность способность обнаруживать всех пациентов с данным заболеванием (с наименьшим количеством ложноотрицательных результатов) ) - 59%), позже полученные результаты были подтверждены в проспективном исследовании у 999 пациентов с бессимптомным течением, которым была запланирована колоноскопия (специфичность - 97%, чувствительность - 43%).

Маркер КРР?

Результаты этой работы позволяют предположить, что дисбиоз при КРР может способствовать канцерогенезу посредством эпигенетических нарушений регуляции генома. По мнению исследователей, CMI определенных генов может представлять собой маркер КРР; его даже можно использовать для прогнозирования эффективности приема пребиотиков у пациентов с умеренным риском.

ВЗК или хронические воспалительные заболевания кишечника, в частности болезнь Крона и язвенный колит, представляют собой группу хронических заболеваний с чередующимися фазами обострения и ремиссии. Они связаны с изменениями в микробиоте кишечника, включающими уменьшение бактериального разнообразия и сокращение численности некоторых видов бактерий. Однако, все больше и больше исследований подтверждают идею одновременного изменения популяции вирусов, которая также обнаруживается в кишечнике, в форме изменения их разнообразия и увеличения количества вредоносных вирусов.

Количество «вирусов-убийц»

Чтобы идентифицировать вирусы, вовлеченные в развитие ВЗК, международная группа исследователей изучала микробиоту кишечника пациентов с болезнью Крона и язвенным колитом во время обострения и ремиссии, а также кишечную микробиоту здоровых субъектов контрольной группы. Результаты показывают, что у 70% людей контрольной группы определяются две основные группы вирусов, образующие «вирусное ядро», которое отсутствует во время болезни. Его заменяет множество умеренных бактериофагов, грозных вирусов, которые уничтожают полезные бактерии, что может объяснить более низкое бактериальное разнообразие, наблюдаемое в микробиоте кишечника пациентов. Авторы также обнаружили различия между двумя заболеваниями. Например, изменения в вирусном и бактериальном составе кишечной микробиоты более выражены у пациентов с болезнью Крона; у пациентов с язвенным колитом отмечается очень мало различий в составе микробиоты между обострениями заболевания и фазами ремиссии; четкое объяснение, почему это происходит, отсутствует.

Новый подход

Комплексный анализ бактерий и вирусов в микробиоте кишечника помогает нам понять изменения, связанные с воспалительными заболеваниями кишечника. Этот подход может в конечном итоге привести к разработке биомаркеров, полезных для диагностики и разработки новых терапевтических стратегий.

Более половины населения проживает в городах, ожидается, что к 2050 году горожанами станут две трети всех людей Земли. Массовая урбанизация приводит к изменению образа жизни сразу в нескольких сферах: питание, архитектура жилья — используется больше промышленных и меньше природных материалов, — уменьшается контакт человека с внешней средой, животными или паразитами ... Одновременно растет распространенность метаболическихи аутоиммунных заболеваний, а разнообразие микробиоты человека сокращается. Связаны ли эти события между собой?

От деревни в джунглях к большому городу

Основываясь на этой гипотезе, группа американских ученых пыталась измерить влияние урбанизации на разнообразие микроорганизмов (главным образом, дрожжевых грибков и бактерий) в домах и у живущих в них людей. Исследование проводили в Бразилии в локациях с четырьмя различными уровнями урбанизации, варьирующимися от самого низкого до самого высокого: Чечерта, деревня посреди джунглей; Пуэрто Альмендра, сельское поселение; Икитос, город; и Манаус, мегаполис. Анализ химических веществ и микроорганизмов, обнаруженных на стенах домов, на полах, кроватях, столах, а также анализ микробиоты (кожи, полости носа, рта, кишечника) владельцев и их домашних животных позволил исследователям выявить существенные отличия между микробными профилями в разных регионах.

Высокое разнообразие профилей микроорганизмов

В городах в жилых помещениях выше содержание химических веществ, являющихся компонентами лекарственных препаратов, моющих средств и гелей для душа, что является следствием привычного образа жизни городских жителей. В домах также выше количество дрожжевых грибков, что, вероятно, обусловлено благоприятными условиями для их развития (отопление, меньше естественного света, более высокие уровни CO₂) и их более низкой чувствительностью к противомикробным средствам. Здесь больше бактерий кожного происхождения и меньше микроорганизмов из окружающей среды. Урбанизация, а также повышение уровня жизни приводят к уменьшению разнообразия микроорганизмов. По мнению исследователей, эти результаты помогают лучше понять функциональные связи между образом жизни, микробиотой и здоровьем. Можно сделать вывод, что и наша микробиота, и наши дома выиграют от более тесного контакта с микробами из внешней среды и от использования материалов природного происхождения.

Целью этого финского исследования «случай-контроль» являлась оценка влияния применения антибиотиков на риск развития болезни Паркинсона (БП). Хотя известно, что у пациентов с БП наблюдаются изменения кишечной микробиоты и что прием антибиотиков может повлиять на состав микробиоты, потенциальная связь между применением антибиотиков и риском развития БП никогда не изучалась.

Исследование «случай - контроль»

Группа исследователей выявила всех пациентов с диагнозом Болезнь Паркинсона в Финляндии в период между 1998 и 2014 гг (13 976 человек) и сравнила у них последствия от применения пероральных антибиотиков в период между 1993 и 2014 гг с последствиями от применения антибиотиков у 40 697 человек контрольной группы. Исследование позволило установить корреляции между использованием антибиотиков и риском развития БП, причем самая сильная связь наблюдалась в отношении макролидов и линкозамидов. Эти антибиотики выводятся с желчью, следовательно, их концентрация в кишечном содержимом высокая, что приводит к выраженным и длительным изменениям микробиоты: у пациентов, которые получали пять таких антибиотиков, риск развития БП в течение 10-15 лет увеличивался на 42%; обычно наблюдалась задержка между появлением периферических поражений и первыми двигательными нарушениями. Однако, по мнению авторов, эта корреляция остается открытой для обсуждения, поскольку она не соответствовала процедуре Бенджамини-Хохберга для контроля частоты ложноположительных случаев (доля ложных отклонений гипотезы или FDR).

Сильная корреляция с применением некоторых антибиотиков

С другой стороны, даже после коррекции на FDR, применение от одного до четырех антибиотиков с антианаэробной активностью ассоциировалось с повышенным риском развития БП на 14-15% в течение 10-15 лет. Основываясь на полученных ранее результатах, этот период времени может соответствовать изменению микробиоты, которое сопровождается каскадом физиологических процессов, приводящих к появлению первых периферических поражений и развитию через несколько лет заболевания. Сходным образом, применение тетрациклинов (10–15 лет назад) или сульфаниламидов и триметоприма (1–5 лет назад) в высокой степени коррелировало с развитием БП. И наконец, при использовании противогрибковых препаратов также наблюдалось увеличение риска развития БП (до 26%) (в случае применения двух препаратов за последние 1-5 лет). Следовательно, взаимосвязь между применением антибиотиков и риском развития БП может быть различной в зависимости от класса антибиотиков и является более выраженной у препаратов с антианаэробной активностью. Кроме того, установлена положительная корреляция между применением антибиотиков широкого спектра действия и риском развития БП.

Влияние изменения микробиоты?

По мнению авторов, поскольку кишечная микробиота преимущественно состоит из анаэробных бактерий, антибиотики с антианаэробной активностью и антибиотики широкого спектра действия могут оказывать выраженное влияние на популяцию микроорганизмов. Это подтверждает все еще предварительную гипотезу того, что изменение микробиоты антибиотиками может объяснить связь между применением антибиотиков и риском развития БП.

Трансплантация фекальной микробиоты (ТФМ) в настоящее время является признанным методом лечения рецидивирующей инфекции Clostridium difficile (CDI), который, однако, широко не распространен. Это может быть связано с отсутствием специализированных центров, трудностями в привлечении доноров или сложностью процедур. Снижение административной нагрузки на стационары за счет создания банков фекалий может способствовать широкому распространению этой методики. Однако их нормативные правила, организация и структура слишком разнообразны, чтобы можно было предоставить всем единые гарантии.

Около 30 экспертов собрались, чтобы выработать единое определение банка фекалий и подготовить Руководство по надлежащей практике. Изучив научную литературу, они достигли консенсуса по 6 темам: 1) общие принципы ТФМ и банка офекалий; 2) отбор и скрининг доноров; 3) сбор, подготовка и хранение образцов кала; 4) услуги и клиенты; 5) регистрация данных, мониторинг результатов и этические вопросы; 6) обновление данных по клиническому применению ТФМ.

Институт микробиоты Biocodex занимается обучением специалистов в области микробиоты человека и не дает никаких медицинских рекомендаций.

Мы рекомендуем вам проконсультироваться с врачом, чтобы ответить на ваши вопросы и пожелания.

Фибромиалгия (ФМ) является одной из самых частых форм хронического генерализованного болевого синдрома, распространенность которого во взрослой популяции составляет примерно 2–4%. Для ФМ характерны боль, усталость, проблемы со сном и когнитивные нарушения. Объективного диагностического критерия помимо этих симптомов не существует, при этом ФМ вызывает значительное снижение качества жизни таких пациентов. Новые знания о взаимодействии между микробиотой (микрофлорой) кишечника и центральной нервной системой, также известном как «ось кишечник – мозг», указывают на возможное изменение обработки и восприятия болевых сигналов. Для более подробного изучения патофизиологии ФМ было проведено сравнение микрофлоры кишечника 77 канадских женщин с ФМ (средний возраст 46 лет; диагноз установлен в среднем 12 лет назад) и 79 контрольных здоровых лиц (11 родственников первой степени родства, 20 членов семьи пациенток и 48 лиц, не состоящих в родстве с пациентками первой группы) на основе анализов 16S рРНК и полногеномных анализов

Виды, ассоциированные с тяжестью ФМ

Между пациентками с ФМ и здоровыми лицами не выявлено различий в разнообразии и общей структуре микрофлоры. Однако при более тщательном изучении отмечена ассоциация между избыточным присутствием нескольких видов бактерий и тяжестью симптомов, связанных с ФМ, включая интенсивность и локализацию боли, усталость, нарушения сна и когнитивные симптомы.

Отличительные особенности

Фекальная микробиота пациенток также имела специфичную сигнатуру по сравнению со здоровыми контрольными лицами. В частности, выявлено 19 видов бактерий, отдельные из которых были относительно менее многочисленными, а другие, напротив, присутствовали в бóльших количествах. Некоторые из этих видов участвуют в метаболизме двух короткоцепочечных жирных кислот: бутирата и пропионата. У пациентов с ФМ концентрация этих жирных кислот в сыворотке изменена, в частности у них отмечаются более высокие уровни бутирата и более низкие уровни пропионата. Возможно, эти жирные кислоты вовлечены в механизм, обусловливающий связь между дисбактериозом и характерными симптомами заболевания. Наконец, некоторые виды бактерий, выявленные у пациентов с ФМ, выявляются и при других дисфункциональных синдромах: синдроме раздраженного кишечника, синдроме хронической усталости, интерстициальном цистите, в то время как другие, по всей видимости, являются специфичными для ФМ.

Алгоритм выявления?

Помимо получения сведений, позволяющих лучше понять фибромиалгию даже разработать потенциальное терапевтическое воздействие, исследователи также проложили путь к возможному созданию диагностического теста для пациентов с ФМ. Представляется, что алгоритм машинного обучения (sidenote: машинного обучения Метод автоматического обучения, при котором искусственный интеллект решает задачу на основе собранных метагеномных и метаболомных данных, в данном случае идентификации различающихся видов бактерий. Wazid M, Das AK, Chamola V, et al. Uniting cyber security and machine learning: Advantages, challenges and future research. ICT Express, 2022; 8(3), 313-321. ) способен только на основании состава микробиоты отличать пациентов с ФМ от контрольных лиц с точностью 87,8%.

Алкогольный гепатит является наиболее тяжелой формой алкогольной болезни печени и ассоциируется с уровнем смертности 20–40 % в течение 1–6 месяцев. Хотя известно, что микробиота кишечникаможет способствовать прогрессированию вызванной этанолом болезни печени у мышей, микробиологические факторы, ответственные за этот процесс, остаются малоизученными. Отсюда и интерес к результатам, опубликованным в журнале Nature, о роли микробиоты в передаче и прогрессировании данного заболевания.

E. faecalis вырабатывает цитолизин

Согласно исследованию, пациенты с алкогольным гепатитом обладают специфическим составом фекальной микробиоты, а именно повышенным в 2700 раз содержанием Enterococcus faecalis, бактерии, обнаруживаемой в кале 80 % таких пациентов. Однако определенные «цитолитические» типы этих бактерий вырабатывают эндотоксин под названием «цитолизин», который противодействует эукариотическим клеткам и грамположительным бактериям. Наличие бактерий E. faecalis с цитолитической активностью представляется связанным с тяжестью течения алкогольной болезни печени и смертностью пациентов.

От цитолизина к очаговым поражениям печени

Откорм мышей, которым был назначен рацион, обеспечивающий высокое потребление этанола (или контрольный изокалорийный рацион без этанола) с цитолитическими или нецитолитическими штаммами E. Faecalis, подтвердил, что цитолитические E. faecalis в большей степени вызывали очаговые поражения печени, жировую дистрофию, воспаления и приводили к более быстрой смерти. Данная бактерия также обнаруживалась у всех мышей, которым было назначено потребление спирта, но не в печени мышей из контрольной группы, что предполагает необходимость присутствия этанола для перемещения E. faecalis из кишечника в печень.

Защитный бактериофаг

Далее исследователи изучили терапевтический эффект бактериофагов, целенаправленно воздействующих на цитолитические E. faecalis у мышей, откорм которых содержал E. faecalis, ответственные за жировую дистрофию печени. Бактериофаги снизили уровень цитолизина в печени грызунов и способствовали регрессу вызванных этанолом очаговых поражений печени. Затем исследователи изучили мышей, колонизированных бактериями из кала пациентов с алкогольным гепатитом. Введение бактериофагов подавило возникновение очаговых поражений, жировой дистрофии печени и привело к уменьшению содержания бактерий Enterococcus.

Терапия будущего?

Эти результаты не только обнаружили связь цитолитических бактерий E. faecalis с тяжестью алкогольного гепатита и уровнем смертности при нем, они также показали, что бактериофаги могут целенаправленно воздействовать на бактерии и, таким образом, составить альтернативу антибиотикам. Тем не менее, необходимы дальнейшие клинические исследования для доказательства валидности цитолизина в качестве биомаркера у испытуемых в исследованиях с участием людей и подтверждения способности бактериофагов обеспечить безопасный и эффективный способ терапии.