Alors qu’on les croyait libérées par les combats féministes des années 2000, les jeunes générations s’avèrent encore moins à l'aise que leurs aînées quand il s’agit de parler des organes génitaux féminins. Et pendant que les quarantenaires, influencées par des spots publicitaires sur la fraîcheur de l’entrejambe, se ruent sur les déodorants intimes, la génération suivante, attentive à son image, se révèle adepte de procédures esthétiques, comme la vulvoplastie (sidenote: Vulvoplastie Chirurgie plastique de la vulve, pour augmenter ou réduire la taille ou le volume des grandes lèvres. ) ¹. A chaque génération son lien avec l’intime, donc. Reste que l’hygiène et la santé de cette zone corporelle fragile doivent être une préoccupation de tout âge… d’où quelques rappels (dé ?)culottés, afin de lever le voile sur d’éventuels tabous.

L’appareil génital féminin est à la fois une terra incognita en termes d’anatomie et un tabou en termes de conversation, y compris chez les femmes. Tant et si bien que les professionnels de santé peinent à comprendre les maux de leurs patientes faute d’explications claires, et/ou parce qu’elles confondent la vulve (partie externe de leur appareil génital) avec leur vagin (partie interne) ¹.

Au point où nous en sommes, autant faire le tour de tous les orifices. D’avant en arrière, le sexe féminin comprend, dans l’ordre, trois ouvertures :

• le méat urinaire, relié à la vessie (qui stocke l’urine) par un canal appelé l’urètre (qui permet d'évacuer l'urine à l'extérieur du corps lors de la miction) ²,
• puis l’entrée du vagin (reproduction),
• puis l’anus (selles).

On parle d’ailleurs de :

Notre intimité ne fait pas exception : comme les autres organes, elle abrite un microbiote ou plutôt des microbiotes avec :

Les microbiotes vulvaire, vaginal, et péri-anal évoluent avec le temps. Par exemple, le microbiote vaginal est sous l’influence de l’âge, des hormones sexuelles et de facteurs extérieurs comme la pollution, le stress, les antibiotiques, etc. ⁴ Des déséquilibres peuvent apparaître : après la ménopause, la chute des œstrogènes induit une perte de lactobacilles et donc une hausse du pH, avec à la clé de fréquentes dysbioses vaginales ⁷. Le microbiote anal dépend quant à lui surtout de l’alimentation et du stress : un excès d’anxiété induit une réponse inflammatoire qui favorise le développement de bactéries pathogènes dans le tube digestif… qui terminent leur course dans la zone périanale ¹.

En parallèle, la proximité des orifices urinaire, vaginal et anal explique de possibles « échanges » de flore entre les 3 microbiotes de ces 3 zones… et la possible invasion du microbiote vaginal par des Escherichia coli digestives par exemple, qui se seraient aventurées au-delà de la zone péri-anale ¹.

Parfois, ce sont paradoxalement des pratiques d’hygiène intime inadaptées qui favorisent les échanges et ou des déséquilibres. Un lavage trop agressif (produits inadaptés) ou trop fréquent (plus d’une fois par jour) de la vulve peut rapidement mettre à mal la fonction barrière de la peau de cette zone, très fragile et très réactive. L’eau seule peut suffire à l’assécher et à l’exposer à des démangeaisons et brûlures ⁸. Quant aux savons parfumés, sprays hygiéniques, lubrifiants, déodorants… que certaines s’auto-prescrivent pour tenter de traiter les odeurs, démangeaisons, douleurs et sécheresses, ils sont contre-productifs ⁴.

Autre erreur récurrente : l’épilation ou le rasage total de la vulve ^1,9. Un phénomène de mode qui concerne 84 % des Américaines préménopausées, pour 2/3 desquelles il s’agit d’une routine quotidienne ou hebdomadaire. Souvent justifié par des raisons d’hygiène, elle est tout au contraire associée avec des lésions qui facilitent l’entrée de bactéries ou de virus. D’ailleurs, on observerait une altération du microbiote vaginal chez les femmes qui décident d’une épilation totale de leur vulve ⁹.

Enfin, le port de vêtements très serrés et synthétique semble favoriser le développement de pathogènes (environnement plus humide et chaud), avec à la clé des démangeaisons et des problèmes urogénitaux plus fréquents ¹.

Pourquoi un tel décalage entre les pratiques et les recommandations ? Les raisons sont sans doute multiples :

• trop peu de femmes sont informées par leur médecin sur les bons gestes : 52 % des femmes interrogées déclarent n’avoir jamais reçu de telles informations et 25 % n’avoir été informées qu’à une seule reprise par leur praticien de santé ;
• la confusion fréquente entre vulve et vagin entretient la mauvaise compréhension des messages ;
• les mythes les plus stupides sont souvent les plus tenaces ¹.

L’enjeu est d’autant plus important que la vulve est la première ligne de défense du système génital des femmes ¹⁰.

Les bons gestes pour préserver le microbiote et le délicat film hydrolipidique protecteur du sexe féminin ? Une routine qui respecte l’équilibre de la vulve et des soins adaptés à l’âge et aux spécificités de chaque femme.

Avec dans tous les cas 3 grands principes immuables ¹⁰ :

• un lavage externe uniquement (= de la vulve, pas de douche vaginale), d’avant en arrière (la vulve puis l’anus)
• sans gant de toilette (susceptible de contenir des bactéries) mais avec vos mains préalablement lavées,
• une fois par jour. Seules les femmes souffrant de diarrhées fréquentes peuvent justifier un lavage externe plus fréquent (du fait des selles plus fréquentes). Idem en période de règles où il est éventuellement possible de procéder à une seconde toilette intime dans la journée.

La bonne santé du microbiote vaginal repose sur une bonne hygiène intime. Mais parfois, cela ne suffit pas et un petit coup de pouce peut s’avérer nécessaire pour re-doper les bonnes bactéries de notre microbiote, avec :

L'endométriose touche environ 10 % des femmes en âge de procréer avec des symptômes comme la dysménorrhée, la dysurie, des douleurs pelviennes et une baisse de la fertilité voire une infertilité.

L’un des diagnostics, invasif (cœlioscopie), retarde la prise en charge. D’où l’espoir de trouver un jour un marqueur non invasif.

C’est peut-être désormais chose faite, au regard des résultats de chercheurs australiens portant sur 3 microbiotes (buccal, intestinal et vaginal) afin d’y identifier une signature bactérienne de l'endométriose.

Plus de diversité dans le microbiote buccal et intestinal

Au total, 64 femmes ont été incluses dans cette étude ¹ :

• 24 ayant des symptômes gynécologiques mais sans endométriose confirmée par cœlioscopie (N-ENDO)
• 21 avec une endométriose confirmée par cœlioscopie (ENDO)
• et 19 femmes témoins sans symptômes gynécologiques ou sans stérilité (HC).

Les analyses de diversité alpha (sidenote: Diversité alpha Nombre d'espèces coexistant dans un milieu donné. ) ont révélé de premières différences : les témoins sains HC présentaient une plus grande diversité de leurs microbiotes buccal et intestinal (mais pas vaginal) que les groupes N-ENDO et ENDO.

Des bactéries qui signent la maladie…

Mais surtout, la flore vaginale des femmes souffrant d’endométriose avérée (ENDO) s’est révélée plus riche en Escherichia, Enterococcus et Tepidimonas.

Leurs selles contenaient davantage de Lactobacillus, mais aussi de Phascolarctobacterium, une bactérie connue pour être davantage présente dans le liquide péritonéal de ces patientes, soulevant l’hypothèse d’une possible translocation bactérienne de l’intestin vers le péritoine.

Enfin, Fusobacterium était davantage présent dans la cavité orale : ce pathogène opportuniste, impliqué dans la maladie parodontale, pourrait-il expliquer l’incidence plus élevée de cette inflammation des gencives chez les femmes souffrant d’endométriose ?

… et sa sévérité

Enfin, les microbiotes semblent également signer la gravité de l’endométriose :

• dans les selles, Actinomyces est davantage présente en cas d'endométriose minime/modérée (stades 1 et 2) et Paraprevotellaceae en cas d'endométriose moyenne/sévère (stades 3 et 4)
• le microbiote oral est enrichi en Cardiobacterium en cas d'endométriose minime/modérée et en Fusobacterium en cas d'endométriose moyenne/sévère
• la flore vaginale contient davantage de Blautia, Dorea, Collinsella et Eubacterium en cas d'endométriose moyenne/sévère.

L'endométriose, cette maladie dans laquelle le tissu de l’endomètre (qui tapisse l’intérieur de l’utérus) se développe en dehors de l’utérus, touche environ 10 % des femmes en âge de procréer. Malheureusement, l’un des diagnostics, reposant sur une cœlioscopie (sidenote: La cœlioscopie La cœlioscopie (ou laparoscopie) est une technique d’exploration et de traitement des organes de la cavité abdominale réalisée en général sous anesthésie générale. Le chirurgien peut, grâce à de petites incisions réalisées sur la paroi abdominale, accéder à l’intérieur de l’abdomen pour diagnostiquer (une endométriose par exemple) ou traiter (ablation de lésions d’endométriose, traitement d’une grossesse extra-utérine, appendicite aiguë…). Approfondir DiZerega GS, Rodgers KE, Peritoneal Fluid. The Peritoneum. 1992. pp 26-56 Sprin… ) , est invasif et retarde la prise en charge qui, faute de remède, se limite à réduire les douloureux symptômes. Mais bonne nouvelle : des chercheurs australiens viennent d’ouvrir la voie à une alternative non invasive de diagnostic. ¹

Et si votre microbiote pouvait dévoiler l'endométriose ?

Ces scientifiques se sont intéressés à 3 microbiotes : buccal, intestinal et vaginal. Objectif ? Tenter d’identifier une « signature bactérienne » de l'endométriose. Et ils y sont parvenus ! Les témoins sains présentaient un microbiote buccal et intestinal (mais pas vaginal) plus diversifié que celui des femmes souffrant d'endométriose. Mais surtout, des changements dans certaines bactéries ont été observés chez les femmes souffrant d'endométriose.

Par exemple, leur flore vaginale contenait davantage d’Escherichia, Enterococcus et Tepidimonas. Leur microbiote intestinal était plus riche en Lactobacillus et de Phascolarctobacterium, une bactérie déjà trouvée dans le liquide péritonéal (sidenote: Liquide péritonéal Liquide présent dans la cavité péritonéale, c’est-à-dire à l’intérieur de la membrane qui entoure les viscères abdominaux. Il joue un rôle de lubrifiant, évitant les frictions entre les organes lors de la digestion.   DiZerega GS, Rodgers KE, Peritoneal Fluid. The Peritoneum. 1992. pp 26-56 Springer New York ) des patientes, suggérant que ces bactéries pourraient migrer de leur tube digestif vers leur péritoine. Côté bouche, Fusobacterium (sidenote: Fusobacterium Genre de bactéries filamenteuses vivant notamment dans la bouche (plaque dentaire), le système digestif, le vagin et, dans une moindre proportion, dans la cavité utérine. Cette bactérie pathogène est notamment impliquée dans la parodontite (inflammation à la base de la dent) et le cancer colorectal. ) était plus présent chez les femmes souffrant d'endométriose modérée à sévère. Or cette bactérie est impliquée dans la parodontite, cette inflammation des gencives qui touche souvent les femmes souffrant d’endométriose. Fusobacterium pourrait-il expliquer le lien entre endométriose et gingivite ? Peut-être.

L’endométriose et sa gravité

Les chercheurs ont également trouvé des différences selon la gravité de l'endométriose. Par exemple, la bactérie Actinomyces était plus présente dans le tube digestif en cas d'endométriose légère à modérée, tandis que Paraprevotellaceae était associée aux formes plus graves. Pour la flore buccale, Cardiobacterium s’impose dans les formes légères et Fusobacterium dans les formes sévères. Côté flore vaginale, l’endométriose grave va de pair avec une présence accrue de Blautia, Dorea, Collinsella et Eubacterium.

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Le microbiote intestinal est souvent appelé le "deuxième cerveau" pour plusieurs raisons :

• L'intestin est l’organe qui contient le plus de neurones après le cerveau. Il contient environ 500 millions de neurones, formant le système nerveux entérique, 
• L’intestin interagit avec le cerveau par différents mécanismes : des connexions nerveuses, des molécules chimiques produites dans l’intestin (par les cellules humaines ou le microbiote) et qui peuvent agir directement sur le cerveau, ou indirectement via des effets sur le système immunitaire par exemple.
• Le cerveau a des effets sur notre intestin. Par exemple, il est fréquent d’avoir des symptômes digestifs (douleurs abdominales, diarrhée) lors d’un évènement stressant comme un examen ou un entretien d’embauche.

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Le microbiote joue un rôle particulier dans la digestion des fibres végétales présentes dans les fruits et les légumes. Ces fibres sont des longues molécules de sucre que nos enzymes humaines sont incapables de couper en morceaux.

Elles arrivent ainsi intactes au niveau du côlon où elles rencontrent une très grande quantité de bactéries, qui, elles, vont être capables de les digérer. Les bactéries vont utiliser ces fibres pour leurs propres besoins et vont relarguer des molécules très importantes pour la santé humaine, les acides gras à chaine courte (sidenote: Acides Gras à Chaîne Courte (AGCC) Les acides gras à chaîne courte sont une source d’énergie (carburant) des cellules de l’individu, ils interagissent avec le système immunitaire et sont impliqués dans la communication entre l’intestin et le cerveau. Silva YP, Bernardi A, Frozza RL. The Role of Short-Chain Fatty Acids From Gut Microbiota in Gut-Brain Communication. Front Endocrinol (Lausanne). 2020;11:25. ) (comme le butyrate par exemple).

Ces acides gras à chaîne courte ont des effets multiples. Le butyrate nourrit les cellules du côlon et favorise ainsi l’intégrité de la muqueuse intestinale (sidenote: De Cruz P, Kamm MA, Hamilton AL, et al. Crohn’s disease management after intestinal resection: a randomised trial. The Lancet. 2015;385(9976):1406–1417 ) . Les acides gras à chaine courte peuvent moduler la réponse immunitaire, et contribuer ainsi à la protection contre les maladies inflammatoires.

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D’abord, il est tout à fait normal que le tube digestif, produise des gaz. En général, un sujet sain produit entre 0,5 et 1,5 litre de gaz par jour.

Et oui, le microbiote intestinal joue un rôle important dans cette production de gaz. Le microbiote, en fermentant les résidus alimentaires qui arrivent au niveau du côlon, va produire différents gaz comme l’hydrogène, le dioxyde de carbone et le méthane.

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Même si on ne les voit pas à l’œil nu, les microorganismes, comme les bactéries, sont partout autour de nous. Ils sont aussi partout sur notre corps.

Le microbiote intestinal est l’ensembles des microorganismes, des bactéries, des champignons et des virus, qui colonisent notre tube digestif à partir de notre naissance.

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La roulette du dentiste : son seul nom suffit à donner des sueurs froides à nombre d’entre nous. Et à nous faire redouter un mal malheureusement banal dans nos sociétés : 2 milliards de Terriens souffrent de caries des dents définitives et 514 millions d’enfants de caries des dents de lait. Parce que les maladies bucco-dentaires, pourtant en grande partie évitables, coûtent cher à nos systèmes de santé, la recherche s’active à trouver des parades. Parmi elles, le microbiote oral.

En effet, notre santé bucco-dentaire pourrait aller de pair avec la présence de certaines bactéries buccales : les gentilles bactéries réductrices de nitrates des genres Neisseria et Haemophilus éloigneraient les caries dentaires et les maladies parodontales, alors que F. nucleatum serait associé aux maladies parodontales (sidenote: Les maladies parodontales Les maladies parodontales touchent les tissus qui entourent et soutiennent les dents. Elles se manifestent par un saignement ou un gonflement des gencives (gingivite), des douleurs et parfois par une mauvaise haleine. Dans les formes les plus graves, la destruction de l’attache qui relie la gencive à la dent et de l’os qui soutient la dent crée des poches qui provoquent une mobilité des dents et parfois leur chute.  Approfondir WHO ) , à la plaque dentaire et à la mauvaise haleine.

Mais quand et comment ces bactéries viennent-elles coloniser notre bouche et décider du devenir de nos dents ? Très tôt, semble répondre une étude ¹ japonaise publiée fin 2024.

Le brossage dès la première dent !

A 1 semaine, alors que l’enfant est nourri de lait, le microbiote oral semble assez immature. Mais la situation va très vite évoluer : entre 6 et 18 mois, suite à l’introduction des premiers aliments solides et à l’apparition des premières dents, le microbiote oral de Bibou devient comparable à celui d’un adulte !

Et surtout, nos bactéries alliées -Neisseria, Haemophilus- et la redoutable Fusobacterium, ont déjà posé leurs valises. Avec un bail longue durée : à partir de 36 mois, le microbiote buccal d’un enfant n’évolue quasiment plus.

Ainsi, tout semble se jouer avant les 3 ans de l’enfant, voire entre 6 à 18 mois : cette courte fenêtre temporelle de maturation du microbiote oral serait essentielle pour la prévention future des maladies bucco-dentaires comme les caries. Et donc pour notre future facture de soins chez le dentiste !

Caries, maladies parodontales, voire maladies systémiques : le microbiote oral est de plus en plus incriminé, et donc étudié. Paradoxalement, sa mise en place progressive dans les premières années de vie reste encore un grand mystère.

D’où l’intérêt d’une étude japonaise ¹ qui a suivi l’évolution du microbiote salivaire de 54 enfants (27 filles et 27 garçons) à 13 moments de leur petite enfance : à 1 semaine puis à 1, 3, 6, 9, 12, 18, 24, 30, 36, 42, 48 et 60 mois (5 ans). Le microbiote oral de leurs parents a aussi été prélevé aux 18 et 36 mois de leur enfant, en tant qu'échantillon représentatif du microbiote adulte.

Une mise en place très rapide

Le microbiote des nouveau-nés est encore assez pauvre : une semaine après leur naissance, on y retrouve seulement 25 % des 110 OTU (sidenote: OTU Pour operational taxonomic unit, ou unités taxonomiques opérationnelles, qui désignent des regroupements de bactéries (qui ne sont pas nécessairement identifiées ou répertoriées dans les bases) présentant au moins. ) détectées chez plus de 85 % des parents aux deux dates de prélèvement.

Les genres bactériens alors présents :

• en général Streptococcus
• Rothia
• et Gemella

Mais la hausse est ensuite très rapide, avec 80 % des OTU parentales présentes entre 6 et 18 mois, suite à l’introduction des premiers aliments solides et à l’apparition des premières dents. 

Les principaux genres bactériens qui s’installent alors :

• Neisseria
• Haemophilus
• et Fusobacterium

Quelles conséquences sur les caries ?

L’attention des scientifiques s’est portée tout particulièrement sur Neisseria, Haemophilus et Fusobacterium : des études antérieures avaient en effet rapporté que leur concentration dans la bouche reflétait l’état bucco-dentaire des patients (absence ou présence de caries et/ou de maladies parodontales).

Or, l’étude japonaise met en évidence une installation précoce de ces trois bactéries :

• à partir de 6 mois, les bactéries réductrices de nitrates des genres Neisseria et Haemophilus, qui préviendraient les caries dentaires et les maladies parodontales, connaissent une hausse rapide ;
• au cours des premiers 18 mois, F. nucleatum, associé aux maladies parodontales, à la plaque dentaire et à la mauvaise haleine, colonise la bouche de l’enfant.