On estime que la mucoviscidose a été diagnostiquée chez 105 000 personnes dans 94 pays. La France a été le premier pays au monde à introduire le dépistage systématique à la naissance.

L'altération de la protéine CFTR en cause

La mucoviscidose est due à une altération de la protéine CFTR (Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator), provoquée par une mutation de son gène. La protéine CFTR normale régule les échanges d’eau et de sels minéraux à travers les membranes cellulaires. Lorsqu’elle est défectueuse, elle va entraîner une augmentation de la viscosité du mucus et son accumulation dans les voies respiratoires et digestives. Cette accumulation fait le lit, au niveau respiratoire, des infections bactériennes et provoque, à terme, une insuffisance respiratoire. Au niveau digestif, la mucoviscidose entraîne une insuffisance pancréatique qui affecte la digestion, l'absorption des nutriments, la croissance et se manifeste par l'alternance de diarrhées et constipations.

Un déséquilibre du microbiote

Par ailleurs, un déséquilibre du microbiote intestinal serait associé aux symptômes respiratoires de la mucoviscidose. Cette dysbiose, observée avant l'apparition des premiers signes, serait aggravée par la maladie et ses traitements antibiotiques. Elle contribuerait à la dénutrition, au retard de croissance et, plus globalement, aux complications digestives et respiratoires des patients.

Réduire les symptômes

La prise en charge des patients est assurée dans des centres spécialisés ; elle vise, notamment, à désencombrer les bronches à l'aide de fluidifiants bronchiques et de bronchodilatateurs, associés à des séances de kinésithérapie respiratoire. Tous les 3 à 4 mois, un traitement antibiotique est prescrit à titre préventif. Les troubles digestifs sont traités par un régime alimentaire hypercalorique, complété par des extraits pancréatiques et des vitamines.

A l'avenir, de nouvelles stratégies thérapeutiques visant à intervenir dans la mise en place des microbiotes dès les premières semaines de vie via l'allaitement ou l'utilisation de probiotiques, pourraient retarder la survenue de l'atteinte respiratoire, renforcer le système immunitaire des patients, et réduire ainsi la morbidité et la mortalité liées à la mucoviscidose

Le plus souvent d'origine virale, les maladies hivernales ont des manifestations cliniques parfois très similaires à celles de la grippe (Virus Influenza), ce qui conduit à les regrouper sous le terme de syndrome grippal ou pseudo-grippal.

Le syndrome grippal, souvent confondu avec la grippe

Le syndrome grippal associe tout ou partie des symptômes suivants : fièvre < 38.5 C, frissons, toux, fatigue, douleurs musculaires, maux de gorge, maux de tête, nez qui coule... Seules des analyses sanguines permettent de le différencier de manière certaine d’une infection par le virus de la grippe.

Un système immunitaire trop sollicité

Les défenses immunitaires intestinales protègent contre les agressions d’agents pathogènes tels que les bactéries ou les virus. Or, en hiver, le système immunitaire est plus souvent agressé. En effet, le confinement est plus important, les pièces sont moins aérées. Par conséquent, la transmission des microbes pathogènes circulant (air expiré, toux, éternuement) est plus importante.

Des cures de probiotiques en étude

L'origine virale des infections respiratoires hivernales exclut d'emblée le recours aux antibiotiques. Le traitement est symptomatique : paracétamol associé à une bonne hydratation et du repos, constituent l’essentiel de l'ordonnance médicale.
La prise de probiotiques a également fait ses preuves dans des études cliniques sur les maladies respiratoires hivernales. Une prise quotidienne de probiotiques pendant plusieurs mois a permis de réduire la fièvre, l’écoulement nasal et la toux. Elle a entraîné également une diminution de la prescription d’antibiotiques et du nombre de jours d’absence dus à la maladie.

Recommandé par notre communauté

Jusqu'à 70% des patients atteints de la maladie de Crohn nécessitent une résection intestinale, parmi lesquels les deux tiers développent une récidive entrainant une nouvelle opération. Le rôle du microbiote associé à la muqueuse intestinale dans la récidive est assez bien décrit, mais peu de données existent quant à l'environnement luminal après résection intestinale. Des chercheurs ont entrepris une vaste étude prospective longitudinale, randomisée, chez 130 patients atteints de la maladie de Crohn après chirurgie, afin d’étudier l’association entre le microbiote intestinal et le risque de récidive.

Enterobacteriaceae et risque de récidive

Une endoscopie a été réalisée pour détecter la récidive de la maladie, à 6 mois chez les 2/3 des patients et une coloscopie chez tous les patients à 18 mois après la chirurgie. Des échantillons de selles ont été prélevés 2 semaines avant la chirurgie et 6, 12 et 18 mois après afin d’analyser le microbiote intestinal par séquençage du gène de l’ARNr 16S. Les résultats révèlent qu’une forte abondance de la famille des Enterobacteriaceae avant l’opération et 6 mois après était associée à un risque accru de récidive de la maladie à 18 mois, tandis que l’augmentation de bactéries appartenant à la famille des Lachnospiraceae était associée à un risque réduit. Les résultats soulignent également que si l'abondance relative de ces familles est importante, l’augmentation de la diversité des espèces au sein de la famille contribue également au risque de récidive ou non.

Un environnement propice à la récidive

Après une chirurgie, l’environnement intestinal est modifié (exposition à l’oxygène, modification du pH, antibiotiques…), entrainant une diminution de la famille des Lachnospiraceae - anaérobies obligatoires - dont certaines espèces sont productrices de butyrate; cette diminution modifierait la disponibilité et le métabolisme du butyrate au sein des colonocytes, entraînant un « switch métabolique » et une augmentation de l'oxygène. Celle-ci serait responsable de la prolifération des Enterobacteriaceae - anaérobies facultatives - estiment les chercheurs. L’intégration de ces nouvelles données aux changements observés au sein de la muqueuse intestinale après chirurgie (sidenote: De Cruz P, Kamm MA, Hamilton AL, et al. Crohn’s disease management after intestinal resection: a randomised trial. The Lancet. 2015;385(9976):1406–1417 )  permettra de fournir une vision complète de la maladie.

Même si le coronavirus touche en premier lieu les poumons, médecins et chercheurs se sont rapidement penchés sur le rôle du microbiote intestinal. Notamment parce que des symptômes intestinaux (vomissements, nausée, diarrhée) semblent plus fréquents dans les formes sévères : 3 méta-analyses portant sur environ 4.000 à 10.000 patients rapportent des prévalences de 10 à 17,6 %. L'infection déclenche une réaction inflammatoire intestinale, mise en évidence par des taux fécaux élevés d’un biomarqueur, la calprotectine.

Présence du virus dans le système digestif

Le SARS-CoV-2 infecte les cellules en se liant notamment au récepteur ACE2 (sidenote: Receptor angiotensinconverting enzyme II ) , qui participe à l’homéostasie du système rénine-angiotensine-aldostérone, cruciale pour la physiologie et la pathologie de tous les organes. ACE2 est fortement exprimé dans le tissu pulmonaire, d’où sa vulnérabilité, mais il l’est également au niveau du cœur, du foie et de l’intestin. Ainsi, le système digestif pourrait être une porte d'entrée du virus via des aliments contaminés. Une transmission fécale-orale pourrait suivre : de l’ARN viral est présent dans les selles d’un patient Covid sur 2, même en l’absence de virus dans les voies respiratoires. En outre, le virus semble capable de se répliquer dans le tube digestif.

Mécanismes potentiels

Plusieurs mécanismes pourraient être impliqués dans les troubles gastro-intestinaux observés :

• Un affaiblissement de la barrière intestinale, lié à une inflammation locale ou à la réplication du virus.

• Une dérégulation de l'ACE2, dont tout déficit accentue la susceptibilité de l'intestin à l'inflammation. Or, il est probable que le SARS-Cov2, qui réduit l’expression d’ACE2 dans les poumons, la limite également dans l’intestin.

• Une altération de la composition et des fonctions du microbiote, consécutive de l’hypoxie liée à la Covid-19.

• Une implication de l’axe intestin-cerveau, le système nerveux entérique pouvant être affecté soit via une infection virale directe, soit via une réponse immunitaire (sidenote: Cytokines inflammatoires par exemple ) , amplifiant la diarrhée et stimulant éventuellement le nerf vague pour favoriser les vomissements.

Dysbiose du microbiote intestinal

Il a été montré qu’un déficit en ACE2 altère la composition du microbiote chez la souris ; les patients Covid-19 présentent une dysbiose intestinale, avec une perte de diversité et d’abondance bactérienne. Or, cette dysbiose est lourde de conséquences : le microbiote intestinal peut stimuler à distance la réponse de l'hôte aux infections virales respiratoires ; inversement, la dysbiose peut aggraver l'issue de la maladie, une moindre présence de bactéries commensales favorisant la surreprésentation de bactéries pathogènes. Le rôle du microbiote intestinal dans les infections à coronavirus reste donc à définir, afin de déterminer s’il constitue un biomarqueur de la gravité de la maladie voire une stratégie thérapeutique.

Même si l’adage : « Les antibiotiques, c’est pas automatique ! » est ancré dans nos têtes, leurs usages en dehors de traitements d’infections bactériennes restent encore trop importants, avec des conséquences sur la santé. En effet, une exposition aux antibiotiques durant les premiers mois de vie pourrait être associée au développement d’un asthme par la suite, une maladie inflammatoire du système respiratoire (sidenote: https://www.who.int/news-room/q-a-detail/asthma ) . Or, les microbiotes intestinal et nasal sont reconnus comme facteurs de risque de développement et de sévérité de la maladie. Sachant que les antibiotiques vont altérer les communautés bactériennes, des chercheurs se sont demandé si l’altération du microbiote nasal pouvait expliquer l’apparition d’un asthme infantile.

Lien antibiotiques-asthme établi

Une équipe a recherché chez environ 700 enfants le lien entre l’exposition d’antibiotiques avant 1 an et le développement d’un asthme à 7 ans. Au total, la moitié des enfants avaient reçu des antibiotiques de 0 à 11 mois et presque 8% d’entre eux avaient développé un asthme par la suite. Cette proportion passait à plus de 11% chez ceux traités avec 2 ou plusieurs antibiotiques avant 11 mois, soit une augmentation de 4% du risque de développer un asthme par rapport aux enfants sans d’antibiotique.

Moraxella, la grande absente du nez

Les chercheurs ont observé que le microbiote du nez évoluait au cours des 2 premières années de vie ; de plus, une antibiothérapie avant 1 an impactait la flore nasale des bébés, d’autant plus fortement que le nombre de traitements augmentait. En particulier, l’absence dans le nez de Moraxella - une bactérie souvent associée aux maladies respiratoires – semblait signer une prise précoce et importante d’antibiotiques. Leur utilisation avant 1 an aurait donc des effets néfastes à long terme sur le microbiote nasal, facilitant ainsi la cascade d’évènements qui conduirait au développement de l’asthme. Même si d’autres acteurs seraient impliqués (comme le microbiote intestinal ou le système immunitaire), ces résultats vont dans le sens des recommandations actuelles encourageant un usage raisonné des antibiotiques, en particulier chez les nourrissons.

La prévalence mondiale de l'obésité a presque triplé entre 1975 et 2016 et constitue un véritable problème de santé publique. La chirurgie bariatrique est, à ce jour, la meilleure stratégie pour entraîner une perte de poids durable chez les patients souffrant d’obésité morbide (sidenote: L'obésité morbide est définie par un indice de masse corporelle (IMC) >40. https://obesitymedicine.org/what-is-morbid-obesity/  ) , avec un taux de succès à 5 ans supérieur à 66 %. Elle repose principalement sur deux techniques, d’efficacité comparable : le court-circuit gastrique (ou plus exactement la dérivation gastrique Roux-en-Y par laparoscopie), et la Sleeve gastrectomie, qui consiste à retirer les 2/3 de l’estomac. Quelles sont les conséquences de ces interventions sur l’écosystème bactérien ? Les deux approches sont-elles équivalentes ?

Un microbiote intestinal enrichi et diversifié

Pour le savoir, des chercheurs ont comparé deux groupes d’une centaine de patients, l’un ayant subi un court-circuit gastrique, l’autre une Sleeve gastrectomie. Six mois après, ils ont observé un enrichissement et une hausse notable de la diversité bactérienne chez l’ensemble des participants, dont 40 % étaient communes aux deux approches ; parmi elles, Akkermansia muciniphila - connue pour être négativement associée à l’obésité - ainsi que certaines protéobactéries comme Escherichia coli, soupçonnée d’influencer à la fois l’appétit et le métabolisme après la chirurgie. En revanche, seul le court-circuit gastrique s’est accompagné d’un appauvrissement en Faecalibacterium prausnitzii, une espèce associée à certains troubles métaboliques et aux maladies inflammatoires de l’intestin.

Le court-circuit gastrique plus impactant

Les deux approches se sont, par ailleurs, traduites par la hausse des systèmes de transport de la vitamine B12, B1, du manganèse, du fer et du zinc, suggérant une augmentation de l’utilisation de ces nutriments par les bactéries. À tous les niveaux, l’impact du court-circuit gastrique était plus important que celui de la Sleeve gastrectomie, soulignent les auteurs. Ils estiment toutefois qu’un recul de 3 à 5 ans sera nécessaire pour établir l’intérêt clinique de ces découvertes, en vue d’orienter préférentiellement les patients vers l’une ou l’autre des deux approches.

Les MICI, maladie de Crohn et rectocolite hémorragique (RCH), se caractérisent par l’inflammation de la paroi d’une partie du tube digestif, liée à une hyperactivité du système immunitaire digestif. Lors des poussées inflammatoires des MICI, surviennent le plus souvent des douleurs abdominales ou des diarrhées parfois hémorragiques. Les malades peuvent aussi présenter des signes extradigestifs : articulaires, ophtalmiques, cutanés, hépatiques.

Les MICI touchent environ une personne sur 1000 en Europe occidentale et se déclarent souvent entre 20 et 40 ans. Ces pathologies ont des évolutions en dents de scie, avec des alternances de poussées et de rémissions. Dans la maladie de Crohn, cette inflammation peut être localisée à tous les niveaux du système digestif, de la bouche à l’anus, même si c’est au niveau de l’intestin qu’on la retrouve le plus souvent. Dans la rectocolite hémorragique, elle est localisée au niveau du rectum et du côlon.

Des maladies multi-factorielles

Les causes des MICI englobent une prédisposition génétique, des facteurs environnementaux, comme la pollution ou l’alimentation, le système immunitaire et le microbiote intestinal. Le manque d’exposition à des micro-organismes dans l’enfance dû par exemple à une hygiène excessive pourrait être impliqué.

Le contenu de l’intestin modifié

Le microbiote intestinal semble jouer un rôle important, mais encore mal connu, dans l’inflammation caractéristique des MICI. De nombreuses études ont observé une dysbiose, c’est-à-dire une modification de l’équilibre du microbiote, en lien avec les facteurs génétiques et environnementaux, chez les malades. Les bactéries anti-inflammatoires sont particulièrement diminuées. Ce déséquilibre modifie le contenu de l’intestin et pourrait créer une inflammation chronique.

Des espoirs de traitements

Il n’existe pas de traitement curatif mais les anti-inflammatoires permettent de limiter les poussées douloureuses. La prise en charge inclut actuellement la corticothérapie, des traitements dits « immuno-modulateurs » qui peuvent freiner les réactions du système immunitaire, comme les anti-TNFα, et la chirurgie dans 80% des cas de Crohn et 20% des cas de RCH. Elle ne permet que rarement de soigner définitivement. Actuellement, les chercheurs ont pour piste de cibler le microbiote dans les MICI en essayant de diminuer la présence des pathogènes et de favoriser la croissance des micro-organismes bénéfiques.

Trois fois plus fréquent qu'il y a 30 ans, l'eczéma atteint jusqu'à 20 % des enfants. C'est devenu la première dermatose infantile dans les pays industrialisés. L'eczéma disparaît toutefois dans la majorité des cas à l'adolescence, seuls 10 à 15 % des patients restant affectés toute leur vie.

Une réaction immunitaire excessive

L'eczéma est lié à une prédisposition génétique qui entraîne une altération de la barrière cutanée. Cette altération ouvre la voie à la pénétration des allergènes dans la peau, provoquant une réaction immunitaire excessive. Des modifications de la composition et de la diversité des microbiotes intestinal et cutané, observées chez les patients, pourraient être impliquées.

L'eczéma se manifeste très tôt dans l'enfance (entre 1 et 3 mois) par une peau sèche et rugueuse, et l'apparition, en période de poussée inflammatoire, de plaques rouges provoquant de fortes démangeaisons.

Limitez l'irritation de votre peau

Le traitement de l'eczéma vise principalement à limiter l'irritation de la peau (port de vêtements en coton, utilisation de gels sans savon, séchage délicat de sa peau...) et à atténuer les lésions cutanées à l'aide de crèmes hydratantes et de dermocorticoïdes locaux. Dans les cas plus sévères, le médecin peut être amené à prescrire des antihistaminiques sur une courte durée.

Les probiotiques amélioreraient les symptômes

Autre approche : corriger la dysbiose (déséquilibre de la flore bactérienne) en modifiant les microbiotes intestinal et cutané. Plusieurs études ont montré que les probiotiques améliorent les symptômes d'eczéma (notamment certains lactobacilles) et diminuent l'inflammation intestinale des bébés atteints. Donnés à titre préventif aux femmes enceintes, ils pourraient diminuer la fréquence d'apparition des symptômes chez leur bébé.

Qu’est-ce que l’asthme ?

Il s’agit d’une maladie chronique du système respiratoire qui se manifeste par une toux, un sifflement, un essoufflement, une gêne respiratoire (difficulté à respirer), ou une association de ces symptômes¹. Ceux- ci sont dus à un rétrécissement des voies aériennes dans les poumons à cause d’une inflammation des bronches¹. L’asthme se manifeste par crises plus fréquemment durant la nuit ou lors d’une activité physique. La sévérité et la fréquence de ces crises varient d’un patient à l’autre¹.

Prédispositions et facteurs déclencheurs de l'asthme

L'asthme est une maladie complexe multifactorielle. Elle peut se développer chez des personnes avec une prédisposition génétique (terrain allergique) et/ou exposées à des facteurs environnementaux comme les allergènes (pollens, acariens), la fumée du tabac ou la pollution de l'air. Des émotions fortes, l'air froid ou l'exercice physique peuvent aussi déclencher des crises. Enfin, des facteurs liés à l'individu peuvent également entrer en jeu, comme une infection, ou encore de l'obésité².

Quel lien avec le microbiote ?

De nombreuses études rapportent le rôle que joueraient nos différents microbiotes dans la maladie :

Vivre avec l’asthme : quels traitements et solutions ?

Si l’asthme ne se guérit pas, des traitements assurent aux patients asthmatiques une meilleure qualité de vie pour leur assurer une vie normale et active. Les traitements symptomatiques permettent principalement de limiter l’intensité des crises aiguës en ouvrant les bronches. Des traitements de fond réduisent, quant à eux, l'inflammation des voies aériennes, afin d'améliorer la fonction respiratoire, réduisant ainsi la sévérité des crises¹. 

Des études scientifiques sur la relation entre le microbiote et l'asthme suggèrent que la modification du microbiote pourrait prévenir cette maladie et poussent les chercheurs à concentrer les efforts de recherche sur l'utilisation de probiotiques et de prébiotiques^16,17. Leur utilisation en tant que traitement est également à l'étude¹⁸.

Existent-ils des facteurs protecteurs ?

Il semblerait que l’exposition à des microorganismes (sidenote: Micro-organismes Organismes vivants qui sont trop petits pour être vus à l'œil nu. Ils incluent les bactéries, les virus, les champignons, les archées, les protozoaires, etc… et sont communément appelés "microbes". What is microbiology? Microbiology Society.   ) pendant la petite enfance soit bénéfique pour prévenir l’asthme. Contrairement aux idées reçues, vivre dans un environnement aseptisé n'a pas forcément un effet protecteur contre les maladies respiratoires. Certaines études montrent ainsi que la poussière des maisons n'est pas nécessairement un facteur de risque de développement de la maladie¹⁹. D'autres études ont mis en évidence une diminution du risque d’asthme chez les enfants nés et élevés à la campagne²⁰, et avec des animaux domestiques²¹.

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400 millions de personnes atteintes 

Picotements, éternuements en série, larmoiements, démangeaisons, obstruction nasale ou nez qui coule... Bien que très fréquente, la rhinite allergique a un réel impact sur la qualité de vie.  Environ 400 millions de personnes seraient impactées par cette allergie respiratoire ¹. 
La rhinite allergique est dite saisonnière (on parle de "rhume des foins") lorsqu'elle est liée aux pollens d'arbres, de graminées ou d'herbacées, et perannuelle lorsqu'elle est due à des allergènes présents toute l'année, comme les acariens, les moisissures ou encore les poils d'animaux (chats, chiens) ². 

Les symptômes de la rhinite allergique 

La rhinite allergique se manifeste par des symptômes très caractéristiques, généralement associés3 : 

• Prurit (démangeaison, irritation) 
• Anosmie (perte de l'odorat) 
• Rhinorrhée (écoulement nasal) 
• Éternuement à répétition 
• Obstruction nasale (nez bouché) 

En cas de rhinite allergique saisonnière ou en cas de rhinite allergique perannuelle, ces symptômes sont exacerbés. 

Des microbiotes modifiés 

Des déséquilibres au niveau du microbiote intestinal et du microbiote ORL (nez-gorge-oreilles), aussi appelés «dysbiose», ont été mis en évidence en cas de rhinite allergique. Cette dysbiose se caractérise par une faible diversité du microbiote intestinal ^4,5, et une composition du microbiote ORL (nez-gorge-oreilles) différente comparativement à des individus sains ^6-8. Enfin, tous les facteurs susceptibles d’impacter le microbiote intestinal (antibiotiques, alimentation …) pendant la période périnatale peuvent avoir des effets à long terme sur la susceptibilité aux allergies ⁹. 

Les traitements de la rhinite allergique 

Le traitement de la rhinite allergique repose sur 3 voies : l’éviction des allergènes, les médicaments et la désensibilisation. Il existe aussi des traitements symptomatiques, visant à améliorer votre confort ¹⁰. Enfin, l'approche consistant à corriger la dysbiose (sidenote: Dysbiose La « dysbiose » n’est pas un phénomène homogène : elle varie en fonction de l’état de santé de chaque individu. Elle est généralement définie comme une altération de la composition et du fonctionnement du microbiote, provoquée par un ensemble de facteurs environnementaux et liés à l’individu, qui perturbent l’écosystème microbien. Levy M, Kolodziejczyk AA, Thaiss CA, et al. Dysbiosis and the immune system. Nat Rev Immunol. 2017;17(4):219-232. )  et rééquilibrer les microbiotes à l'aide de probiotiques fait l'objet d’études dont les résultats semblent prometteurs. Ces probiotiques seraient efficaces pour améliorer les symptômes de la rhinite allergique et améliorer la qualité de vie des patients ¹¹. 

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