Faudra-t-il désormais dire « bien dans son microbiote cutané ” plutôt que « bien dans sa peau » ?

C’est en substance ce que suggère une étude britannique qui tisse un lien entre le bien-être psychologique et les microorganismes qui peuplent notre peau, plus précisément de la peau du visage, du cuir chevelu, de l’avant-bras et aisselles, sur la base de l’étude de 53 Britanniques âgés en moyenne de 63 ans.

Cette recherche met en lumière un système d’interactions entre peau et cerveau, en écho aux dynamiques déjà connues dans l’axe intestin-cerveau.

Davantage de Cutibacterium, davantage de bien-être ?

L’étude montre pour la première foisune présence accrue de certains genres bactériens chez les participants les mieux dans leur peau, que ce soit en termes de bien-être général ou de bien-être de la zone cutanée incriminée. La bactérie cutanée la plus souvent présente chez les Britanniques les mieux dans leurs corps : Cutibacterium (sidenote: Cutibacterium Genre de bactéries dont le classement a été beaucoup remanié ces dernières années (jusqu’en 2016, on parlait de Propionibacterium). Ce genre bactérien comprend plusieurs espèces donc la célèbre C. acnes (pathogène opportuniste impliqué dans l’acné et dans des infections de prothèses mammaires, d’épaule, etc.,) mais aussi C. avidum, C. granulosum, C. namnetense et C. humerusii. Ahle CM, Feidenhansl C, Brüggemann H. Cutibacterium acnes. Trends Microbiol. 2023 Apr;31(4):419-420. ; CTCB ) .  Vous en avez davantage sur le visage ? Vous devez être peu stressé(e). Vos aisselles en regorgent : votre humeur a de fortes chances d’être au beau fixe et votre niveau de stress au plus bas. À l’inverse, une moindre présence de cette bactérie pourrait contribuer à des troubles comme le stress, l’anxiété ou la dépression.

A noter que cette trouvaille a de quoi surprendre : quand on parle de Cutibacterium, c’est surtout l’image de C. acnes et de cauchemars pubertaires qui viennent à l’esprit. Et non celle de la zénitude des seniors britanniques. Ainsi cette bactérie pourrait aussi participer à notre santé cutanée en repoussant les pathogènes et en régulant l’acidité de la peau, grâce à sa capacité à transformer le sébum en acides gras libres.

Cause ou conséquence ?

Reste la question centrale : la présence de Cutibacterium est-elle une cause ou une conséquence du bien-être ? Autrement dit, est-ce la présence de Cutibacterium qui nous rend heureux ou est-ce notre bien-être qui les attire sur notre peau ?  A moins que les deux résultent d’un autre dénominateur commun (le style de vie, le sport, l’alimentation par exemple)

Impossible de trancher à ce stade. On sait que la peau et son microbiote cutané offrent une barrière protectrice à notre corps, repoussant les pathogènes... et donc nous offrant sécurité et tranquillité. Inversement, il a été montré que le stress, l’anxiété ou la dépression peuvent impacter notre peau, en entraînant l’apparition de troubles cutanés notamment l’eczéma (ou dermatite atopique), le psoriasis, l'acné, ou les odeurs au niveau des aisselles.

Nous avons entendu parler de l’axe intestin-cerveau, maintenant, il existe l’axe peau-cerveau bidirectionnel, le premier influençant le second et vice-versa. Et pour la première fois, une relation entre microbiote cutané et bien-être psychologique est mise en évidence. De quoi inviter la recherche en psychodermatologie (sidenote: Psychodermatologie La psychodermatologie est un domaine relativement nouveau de la médecine, qui se concentre sur les interactions entre l'esprit et la peau. Le traitement des troubles psychodermatologiques se concentre sur l'amélioration de la fonction, la réduction de la détresse physique, le diagnostic et le traitement de la dépression et de l'anxiété associés aux maladies de la peau, la gestion de l'isolement social et l'amélioration de l'estime de soi du patient. Les interventions pharmacologiques et psychologiques sont utilisées dans le traitement des troubles psychocutanés. Approfondir Jafferany M, Franca K. Psychodermatology: Basics Concepts. Acta Derm Venereol. … ) à étudier plus avant les bactéries impliquées et leur influence potentielle sur notre santé cutané et général.

Troisième type de tumeur le plus fréquent, le cancer colorectal (CCR) est le deuxième cancer le plus meurtrier. Le microbiome intestinal semble jouer un rôle crucial dans la carcinogenèse. Pour autant, la recherche reste trop lacunaire pour utiliser le microbiote comme outil de dépistage clinique, alors même qu’une détection précoce augmenterait les chances de survie.

D’où l’intérêt de travaux publiés en 2025 dans Nature Medicine reposant sur l’analyse de 18 jeux de données : 12 issus de base pré-existantes réunissant 2 116 personnes (930 patients atteints de CCR, 210 d'adénomes et 976 témoins sains) et 6 issus de nouvelles cohortes (1 625 individus) fournissant à la fois des informations sur le stade du cancer et l'emplacement anatomique des tumeurs. Soit un total de 3 741 individus, laissant espérer une puissance statistique et une précision des résultats.

Des espèces impliquées, notamment orales

Les auteurs ont détecté 3 866 espèces bactériennes, 15 eucaryotes et 23 archées. Les microbiotes des témoins diffèrent largement de ceux des patients CCR, confirmant les résultats des précédentes études : 125 espèces s’avèrent plus abondantes chez les malades (106 connues et 19 inconnues) et 83 chez les témoins (53 connues et 30 inconnues).

Parmi les espèces plus abondantes chez les malades, figurent 5 sous-espèces de F. nucleatum : F. nucleatum subsp. animalis, vincentii (2 sous espèces différentes), nucleatum, polymorphum. S’y ajoutent d'autres bactéries déjà associées au CCR telles que P. micra et B. fragilis.

L’action du microbiote intestinal pourrait impliquer la régulation de l'ammoniac dans le microenvironnement tumoral du CCR. 

Une part importante des bactéries intestinales spécifiques du CCR se révèlent être des espèces typiquement orales : c’est ainsi le cas de 21 des 125 espèces plus abondantes chez les maladies (16,8 %), dont 11 typiques de la plaque dentaire.

Prédire le CCR

Mais surtout, ce vaste jeu de données a permis d’améliorer la précision de la prédiction du CCR sur la base d’un simple prélèvement de selles : l’aire sous la courbe (AUC), critère d’évaluation de la performance de ce type de modèle, atteint désormais 0,85, soit une amélioration comparativement aux précédentes études (0,81 maximum). Une large partie de cette prédiction repose sur les bactéries typiquement orales.

Les auteurs montrent également :

• Que les biomarqueurs microbiens sont liés à la présence de la tumeur,
• Qu’ils varient selon le stade de la maladie : l’abondance de P. micra et F. nucleatum augmente dès le stade I du CCR, tandis que celle d’Akkermansia muciniphila et Parabacteroides distasonis croit aux stades avancés, suggérant que les évolutions du microbiote se produisent de manière continue et s'accentuent avec la progression du cancer (séquence adénome-carcinome).
• Et qu’ils diffèrent également selon la localisation de la tumeur : trois espèces typiquement orales étaient par exemple significativement accrues dans le cancer colorectal proximal.

De précédent travaux avaient impliqué l’ammoniac de l’environnement tumoral dans l’épuisement de cellules T et la progression du cancer.

Au cours de la vie d’une femme, microbiote vaginal évolue… au point parfois de changer de type (voir encadré), comme l’a montré le suivi ¹ de 125 jeunes femmes de 18 à 25 ans, ayant une vie sexuellement active, résidant dans le Sud de la France (Montpellier).

Lactobacilles, garants de stabilité

Premier enseignement de l’étude : les communautés bactériennes dominées par les Lactobacilles – des bactéries en bâtonnet connues pour être les plus favorables à la santé intime des femmes –, sont aussi plus stables dans le temps. Autrement dit, si votre microbiote vaginale est riche en Lactobacilles, que ce soit des L. crispatus, L. gasseri, L. jensenii, ou L. iners, elle sera plus difficile à ébranler.

Un microbiote vaginal équilibré et dominé par ces Lactobacillus limite la prolifération des pathogènes, mais cela peut tout de même arriver si vous mettez votre microbiote à trop rude épreuve !

Soirées arrosées, flore vaginale perturbée

Second enseignement : la liste des facteurs susceptibles de mettre la pagaille dans notre flore vaginale !

Au rang des suspects identifiés chez nos 125 étudiantes : l’alcool, facteur ayant l’effet le plus fort et le plus constant, qui favorise une flore sous-optimale et augmente la vulnérabilité du vagin aux infections, notamment en facilitant la la prolifération de bactéries pathogènes.

Partenaires, hygiène et antibiotiques

D’autres facteurs pourraient également influencer la transition d’une communauté bactérienne vaginale vers une autre :

• un nombre plus élevé de partenaires sexuels augmenterait le risque de maintenir (ou de passer à) une flore non optimale et favoriser ainsi l’apparition d’infections vaginales pouvant évoluer en vaginose bactérienne. 

• L’utilisation de produits d’hygiène intime (crèmes, comprimés, capsules, gels et lingettes) aurait des effets variables sur la santé d’une femme à l’autre, avec de possibles évolutions circulaires d’un type de flore à l’autre

• Quant à la prise d’antibiotiques, elle semblait peu associée à une transition vers une flore vaginale d’un autre type. Cette absence d’effet observée a surpris les chercheurs : les prélèvements étaient-ils trop espacés pour « capturer » le court changement de flore éventuellement lié à l’antibiotique ?

Chez le poisson zèbre, une protéine bactérienne favorise la prolifération des cellules β dans les îlots pancréatiques. Quid chez les mammifères ? Après la naissance, la prolifération de ces cellules nécessaires à une production suffisante d’insuline, augmente rapidement, au moment même où le microbiote intestinal se diversifie.

Simple coïncidence ou véritable lien, comme chez le poisson zèbre ? Une équipe anglaise ¹ a tranché en montrant chez des souriceaux que le développement postnatal des cellules β est stimulé par des espèces bactériennes et fongiques durant de courtes fenêtres de colonisation, période également critique pour la santé métabolique.

Chez la souris et chez l’homme

En éliminant et en restaurant le microbiote à différentes périodes pré- et postnatales chez des souriceaux, l’équipe a identifié une période critique (du 10e au 20e jour après la naissance) durant laquelle la flore digestive est indispensable à l’établissement d’une masse normale de cellules β. Ces observations ont été confirmées par des expérimentations avec des antibiotiques et des antifongiques, soulignant l’implication de bactéries et de champignons dans le maintien de l’équilibre de la glycémie.

Et chez l’homme ? Des échantillons fécaux de nourrissons humains âgés de 7 à 12 mois (mais pas d’autres tranches d’âge) stimulaient fortement la masse de cellules β chez la souris l’Homme possèderait donc également une fenêtre de colonisation par des microorganismes favorisant les cellules β.

Un argument de plus en faveur de la fameuse fenêtre d’opportunité des 1000 jours pour la santé future et la prévention des maladies métaboliques comme l’obéisté.

Les bactéries et champignons responsables

La comparaison de communautés microbiennes capables d’induire (ou non) le développement des cellules β a permis d’identifier des taxons bactériens et fongiques impliqués chez la souris : Escherichia coli, Enterococcus gallinarum et Candida dubliniensis. Ce dernier s’avère le plus efficace, via un mécanisme impliquant des macrophages, des cellules β, qui permet la reconnaissance de signaux spécifiques issus de la paroi cellulaire de levures commensales.

Enfin, non seulement C. dubliniensis réduit la prévalence et la gravité du diabète dans des modèles murins, mais il participe à restaurer la population de cellules β après une ablation ou un sous-développement consécutif à un traitement antibiotique. ces traitements, en perturbant le microbiote intestinal durant la petite enfance, peuvent altérer la régulation de la glycémie, et nuire au maintien d’un poids corporel stable C. dubliniensis pourrait-il être utilisée à titre prophylactique pour compenser les pertes induites par un traitement antibiotique, en particulier chez les individus prédisposés au diabète de type 1 ou 2 ou à l’obésité ?

Prévenir voire inverser la perte de cellules β ?

Ainsi, cette étude montrequ’il existerait une fenêtre critique chez le jeune enfant, entre 7 et 12 mois, durant laquelle certaines bactéries et champignons seraient nécessaires au développement des cellules β pancréatiques. Si cette fenêtre de développement est manquée, le développement des cellules β serait compromis, avec à la clé un dysfonctionnement et un risque accru de maladies métaboliques comme l’obéisté et de diabète.

Néanmoins, les mécanismes identifiés par les auteurs pourraient peut-être permettre de prévenir voire inverser la perte des cellules β à condition d’une prise en charge précoce, intégrant notamment le rôle clé du microbiote intestinal.

Faudra-t-il un jour s’assurer que le microbiote vaginal est bien équilibré avant de retirer des polypes utérins ? C’est bien possible à en croire une étude publiée dans l’European Journal of Obstetrics and Gynecology. Les auteurs, des chercheurs de l’Université de Nanning en Chine, ont démontré que la présence d’une dysbiose vaginale était un facteur de risque majeur de récidive de polypes après leur résection. ¹

Le lien entre dysbiose et récidive repose sur l’impact de ce déséquilibre microbien sur le vagin et l’utérus, deux zones anatomiques étroitement connectées sur le plan immunitaire et microécologique.

Près de 700 femmes enrôlées

Pour mettre ce résultat en évidence, les chercheurs ont prélevé des échantillons de sécrétions vaginales de 679 femmes âgées de 25 à 50 ans qui allaient subir une « résection hystéroscopique », l’opération visant à retirer des polypes endométriaux.

Après l’intervention, les femmes ont été suivies durant deux années et les chercheurs ont pu identifier une récidive de polypes chez 105 d’entre elles.

L’analyse des sécrétions indique que les femmes qui, avant l’opération, présentaient une dysbiose vaginale avaient un risque multiplié par 3,3 de récidive. C’était également le cas des femmes souffrant d’endométriose.

L’analyse des microbiotes vaginaux indique que, chez les femmes « récidivantes », la densité et la diversité des bactéries, tout comme la présence de Lactobacilles, étaient nettement plus faibles que chez celles chez qui aucune récidive n’avait été détectée. On y retrouvait également davantage de microorganismes pathogènes, tels que la bactérie Gardnerella vaginalis, en cause dans la vaginose, ou le champignon Candida, responsable de la mycose.

Les chercheurs ont également observé une élévation de l’activité de certaines enzymes comme la leucocyte estérase, signe d’inflammation persistante dans le vagin, pouvant favoriser une infection ascendante vers l’utérus.

La baisse des Lactobacillus, facteur clé de récidive

Comment ces anomalies du microbiote vaginal sont-elles impliquées dans la résurgence de polypes ? Pour les chercheurs, la réponse est à chercheur du côté des Lactobacillus.

En temps normal, ces bactéries produisent des bactériocines, des substances capables de détruire les pathogènes, ainsi que de l’acide lactique, qui acidifie l’environnement vaginal et stabilise le microbiote. Elles synthétisent également des molécules appelées « glycérophospholipides » qui favorisent la sécrétion, par l’organisme, de prostaglandines, des messagers anti-inflammatoires. Enfin, elles augmentent la synthèse de protéines impliquées dans l’intégrité de la paroi vaginale.

Ainsi, les Lactobacillus, en diminuant le risque d’infection et d’inflammation après l’opération, exerceraient un effet protecteur contre la récidive des polypes.

Cette action bénéfique est d’autant plus essentielle chez les femmes ayant des antécédents de déséquilibres microbiens chroniques ou d’endométriose, chez qui le risque de récidive est significativement plus élevé.

Vers des traitements préventifs

Les chercheurs soulignent l’importance de maintenir l’équilibre du microbiote vaginal, notamment la dominance à long terme des Lactobacillus, en cas de polypes utérins. Ils évoquent pour ceci plusieurs traitements préventifs possibles :

• l’association probiotiques/antimicrobiens qui permettrait de s’attaquer aux déséquilibres pathogènes immédiats tout en favorisant une santé microbienne durable ;
• les gels ou les suppositoires à base d’acide lactique ;
• les bactériophages, des virus capables de détruire sélectivement les bactéries pathogènes sans perturber le microbiote ;
• les prébiotiques et les oméga-3, favorables à l’équilibre du microbiote.

Ces stratégies de modulation pourraient également améliorer la santé globale du vagin en réduisant le risque d'infection persistante.

Des études doivent encore être menées pour évaluer l’efficacité de ces interventions, mais ces pistes sont prometteuses. Affaire à suivre donc…

Le sommeil est-il lié au microbiote ?

Le microbiote pourrait-il jouer un rôle dans les troubles du sommeil ?

Existe-t-il un lien entre le microbiote, les habitudes de sommeil et le niveau d'énergie ?

Sommeil, humeur et axe intestin-cerveau

Dans certains cas, les nuits blanches et les épisodes d'insomnie peuvent être liés à des troubles psychiatriques. Pour en savoir plus sur la façon dont le microbiote pourrait influencer la santé du cerveau et l'humeur, consultez les liens ci-dessous.

C’est une des énigmes de la cancérologie : les effets abscopaux (sidenote: Effet abscopal Du latin ab- « éloigné » et du grec skopos « cible », littéralement « loin de la cible » - Régression de lésions tumorales situées en dehors du champ d’irradiation, car l’irradiation d’une lésion peut entraîner l’activation de réponses immunitaires antitumorales, ou potentialiser leur efficacité, conduisant ainsi à la destruction de lésions non irradiées par les effecteurs immunitaires antitumoraux. Approfondir https://doi.org/10.1016/j.mednuc.2024.11.007 ) de la radiothérapie, observés chez certains patients mais pas d’autres. Avec néanmoins une avancée importante en 2025 : une équipe internationale a montré que l'irradiation intestinale à faible dose (ILDR) augmente les bénéfices cliniques des immunothérapies ciblant les inhibiteurs de points de contrôle (sidenote: Immunothérapie reposant sur des anticorps monoclaux dirigés contre les points de contrôle du système immunitaire ) ou de la chimiothérapie, dans 8 cohortes rétrospectives de patients et dans un modèle préclinique chez la souris. Cette recherche met ainsi en lumière le rôle essentiel de l’environnement intestinal dans la réponse au traitement.

Une question de dose…

Point de départ des chercheurs : des patients atteints de tumeurs métastatiques inclus dans un essai multicentrique de phase 2, qui ont reçu une radiothérapie stéréotaxique d’ablation (SABR) (sidenote: SABR (radiothérapie stéréotaxique d’ablation) aussi appelée RSC (radiothérapie stéréotaxique corporelle) Radiothérapie qui repose sur l’émission de nombreux faisceaux de radiation de différents angles qui se rencontrent sur la tumeur. La tumeur reçoit donc une forte dose de radiation, alors que chaque faisceau qui circule dans le tissu voisin est de faible dose. Cela réduit les effets de la radiation sur le tissu sain entourant la tumeur. La RSC est administrée en moins de séances que la radiothérapie externe standard. On peut avoir recours à la RSC pour traiter les tumeurs au pancréas, au poumon, au foie ou à la colonne vertébrale. Approfondir https://cancer.ca/fr/treatments/treatment-types/radiation-therapy/external-radi… ) en combinaison avec un anticorps anti-PD-L1. Parmi eux, 13 patients (41 %) exposés à une ILDR accidentelle, avec une dose médiane de radiothérapie de 3,3 Gy au duodénum, 1,0 Gy au jéjunum/iléon, et 1,3 Gy au côlon, ont affiché un bien meilleur taux de survie à 24 mois : 38 % (5/13) contre 5 % (1/19) ! Ce résultat met en lumière l'efficacité accrue d’un traitement combiné.

Poussés par ce résultat inattendu, les chercheurs ont repris les résultats de 7 cohortes indépendantes de patients atteints de cancer, soit un total de 388 patients. Même constat alors : une ILDR fortuite administrée à des doses de 0,25 à 3 Gy améliore la survie de patients atteints de cancer avancé.

… et de bactéries

La réponse immunitaire anti-tumorale et la survie semblent également liées aux différences de flores intestinales entre les individus: comparativement à des adultes en bonne santé, les non répondeurs au traitement associant une ILDR et des anticorps anti-PD-L1 abritaient, avant traitement, moins d’espèces de bactéries typiques des répondeurs (Christensenella minuta et Ruminococcus bromii) et davantage d’espèces de bactéries typiques d’une mauvaise réponse au traitement (Enterocloster aldensis et Parabacteroides distasonis).

Il semble que les interactions métaboliques et immunitaires entre l’hôte et le microbiote intestinal permettraient l’activation des cellules T CD8⁺. Diverses souches de Christensenella minuta semblent renforcer sélectivement l’efficacité de l’ILDR et de l’anti PD-L1, en favorisant la migration des cellules dendritiques intestinales exprimant PD-L1 vers les ganglions lymphatiques drainant la tumeur.