Бронхиальная астма, аллергический ринит, пищевая аллергия и атопический дерматит часто изучают по отдельности, хотя все они развиваются по сходным механизмам (воспалительные реакции, иммуноглобулин Е). Может ли у них быть что-то общее с кишечной микробиотой, которая созревает параллельно с иммунной системой ребенка? Чтобы ответить на этот вопрос, ученые проанализировали данные 1115 детей из крупного продольного исследования CHILD, из них 592 ребенка с диагнозом одного или нескольких аллергических расстройств, установленным после достижения 5-летнего возраста, и 523 ребенка без признаков аллергической сенсибилизации. С помощью регрессионного анализа удалось выявить несколько факторов риска, таких как мужской пол, наличие аллергий у родителей и получение антибиотиков в течение первого года жизни. Грудное вскармливание в первые шесть месяцев жизни и европеоидная раса ассоциировались с меньшим риском возникновения аллергии.

Менее зрелая микробиота кишечника

Результаты анализа образцов кала детей с аллергией, взятых в 3 месяца и в 1 год, показали задержку созревания микробиоты по части микробного разнообразия. Если у детей из контрольной группы кишечная флора развивалась в соответствии с возрастом, у детей с аллергией ее созревание задерживалось. Менее зрелая микробиота в возрасте одного года ассоциировалась с повышенным риском возникновения любого аллергического заболевания в возрасте пяти лет.

Дисбиоз кишечной микробиоты

Характеристики кишечного дисбиоза в однолетнем возрасте у будущих детей-аллергиков включали уменьшение содержания четырех видов бактерий, продуцирующих короткоцепочечные жирные кислоты (продуцирующие бутират Anaerostipes hadrus, Fusicatenibacter saccharivorans, Eubacterium hallii и ацетат Blautia wexlerae), а также увеличение содержания пяти патогенных видов бактерий (Eggerthella lenta, Escherichia coli, Enterococcus faecalis, Clostridium innocuum и Tyzzerella nexilis). Увеличение содержания C. innocuum и T. nexilis коррелировало с применением антибиотиков, преобладание C. innocuum, E. lenta, E. faecalis и T. nexilis — с характером питания ребенка (грудное или искусственное вскармливание) в полугодовалом возрасте, а преобладание C. innocuum и E. lenta — с наличием атопии у отца.

Прогнозирование или профилактика аллергий с помощью метаболитов

Параллельно исследователи выявили 11 метаболических путей, активность которых значительно изменялась минимум при двух аллергических заболеваниях. Из них 9 патологических путей коррелировали с E. coli, а 2 защитных — с B. wexlerae, F. saccharivorans, A. hadrus и E. hallii.
Анализ метаболитов кишечной микробиоты позволил выявить ассоциации с развитием аллергии в более старшем возрасте, например, повышение концентрации следовых аминов (фенилэтиламин, триптамин и тирамин), способствующих воспалению, и снижение продукции бутирата. Таким образом, связь между нарушениями созревания микробиоты и развитием аллергии в возрасте пяти лет, по-видимому, опосредуется этими метаболитами, которые можно использовать для прогнозирования и/или профилактики детской аллергии.

Обычно использование лекарственных препаратов строго регламентировано и невозможно без одобрения регуляторными органами (регистрации). В особых случаях пациенты могут получить еще не одобренный препарат в рамках специальных благотворительных программ. Такие пациенты имеют тяжелые или редкие заболевания, для которых не разработано эффективного лечения, а времени ждать, пока исследуемая терапия получит одобрение и выйдет на рынок, у них просто нет. Молодой 30-летней женщине, которая долго не могла родить второго ребенка из-за постоянных выкидышей (один из них произошел на шестом месяце беременности), в рамках такой программы выполнили трансплантацию влагалищной микробиоты. В сентябре 2021 года ей «пересадили» здоровую влагалищную микробиоту от женщины-донора.

Применение ТВМ для лечения вагинального дисбиоза

Но почему? У этой женщины имело место нарушение баланса вагинальной микробиоты, в ней доминировали не полезные лактобактерии (sidenote: Лактобактерии Палочковидные бактерии, основным свойством которых является производство молочной кислоты, в связи с чем их еще называют «молочнокислые бактерии». Лактобактерии присутствуют в микробиоте полости рта, влагалища и кишечника человека, а также в организме животных и в растениях. Они содержатся в ферментированных продуктах — сырах, йогуртах, соленых огурцах, квашеной капусте и т. д. Лактобактерии также содержатся в пробиотиках, причем своими полезными свойствами пробиотики обязаны именно некоторым видам лактобактерий.   W. H. Holzapfel et B. J. Wood, The Genera of Lactic Acid Bacteria, 2, Springer-Verlag, 1st ed. 1995 (2012), 411 p. « The genus Lactobacillus par W. P. Hammes, R. F. Vogel Tannock GW. A special fondness for lactobacilli. Appl Environ Microbiol. 2004 Jun;70(6):3189-94. Smith TJ, Rigassio-Radler D, Denmark R, et al. Effect of Lactobacillus rhamnosus LGG® and Bifidobacterium animalis ssp. lactis BB-12® on health-related quality of life in college students affected by upper respiratory infections. Br J Nutr. 2013 Jun;109(11):1999-2007. ) , как в нормальной микрофлоре, а патогенные бактерии рода Gardnerella. Из-за этого пациентка в течение девяти лет отмечала зуд и обильные желто-зеленые неприятно пахнущие выделения из влагалища. Симптомы усугублялись во время попыток забеременеть и не поддавались никакому лечению...

Успешная беременность

Трансплантат прижился очень быстро. По мере того, как донорские лактобактерии колонизировали влагалище пациентки, симптомы дисбиоза исчезли. В феврале 2022 года пациентка самостоятельно забеременела, в ее микрофлоре по-прежнему доминировали лактобактерии. На шестой неделе беременности анализ микрофлоры вновь показал наличие Gardnerella spp. Это не вызвало опасений у исследователей, поскольку через две недели женщине была запланирована вторая процедура трансплантации влагалищной микробиоты. Однако, анализ в предполагаемый день трансплантации не выявил патогенных микробов, поэтому необходимость в повторной процедуре отпала. Когда пришло время, женщине выполнили плановое кесарево сечение и у нее родился совершенно здоровый мальчик.

Пока еще рано думать, что трансплантация влагалищной микробиоты — это «волшебное» лекарство от женского бесплодия. Стоит отметить, что у пациентки было еще одно заболевание, провоцирующее выкидыши, лечение которого могло частично или полностью объяснить успех этой беременности. Другими словами, нельзя недооценивать результаты этого важного исследования, однако следует помнить, что путь к успеху никогда не бывает легким.

Для ученых понятие «ассоциация» означает два происходящих одновременно явления с обязательной причинно-следственной связью. Является ли дисбиоз кишечника (т.е. дисбаланс состава микрофлоры кишечника), наблюдаемый у лиц, инфицированных вирусом иммунодефицита человека (ВИЧ), причиной или следствием заболевания? Или и тем, и другим? В преддверии Всемирного дня борьбы со СПИДом 1 декабря давайте рассмотрим данные последних исследований, в которых оценивали кишечную микробиоту людей, у которых впоследствии была выявлена ВИЧ-инфекция, с точки зрения факторов, влияющих на развитие дисбиоза, включая возраст, диету, применение антибиотиков и даже сексуальное поведение ^2,3.

Чтобы получить более четкую картину, американские исследователи собрали образцы микробиоты кишечника примерно 50 мужчин, имеющих половые контакты с мужчинами. Были отобраны участники со сходными характеристиками (возраст, этническая принадлежность, сексуальное поведение и т. д.), у половины из которых был выявлен ВИЧ во время исследования, а у второй половины сохранялся ВИЧ-отрицательный статус. Это позволило сравнить кишечную микробиоту инфицированных мужчин до и сразу после инфицирования, а также кишечную микробиоту неинфицированных мужчин.

^{Источники}

Минимальные изменения микробиоты до и после инфицирования ВИЧ...

Авторы обнаружили, что состав кишечной микробиоты инфицированных мужчин мало изменился в острую фазу ВИЧ-инфекции. Наблюдалось только увеличение содержания Fusobacterium mortiferum. Этот вид бактерий, не являющийся резидентом нормальной кишечной флоры, ранее был ассоциирован с ВИЧ в других исследованиях.

... но значительные различия до инфицирования по сравнению с контролем

Напротив, кишечная микробиота  мужчин, у которых впоследствии была выявлена ВИЧ-инфекция (т.е. доинфекционная микробиота), отличалась от таковой участников контрольной группы (у которых не было ВИЧ-инфекции). В частности, у них было меньше бактерий из группы Bacteroides и больше — Megasphaera elsdenii, Acidaminococcus fermentans и Helicobacter cinaedi. Этот тип дисбиоза часто наблюдался у ВИЧ-инфицированных лиц. Однако, по мнению авторов, в рассматриваемом исследовании дисбаланс кишечной микробиоты, по-видимому, присутствовал до заражения, потенциально влияя на восприимчивость к ВИЧ.

Кишечная микробиота— новый инструмент для профилактики ВИЧ?

Итак, влияет ли состав кишечной микробиоты на восприимчивость к ВИЧ-инфекции? Воодушевленные подобными выводами другой команды исследователей из США⁵, авторы предлагают изучить данный вопрос на большем количестве участников. Они надеются, что это позволит выявить «сигнатуры кишечной микробиоты», ассоциированные с большей восприимчивостью к ВИЧ-инфекции, что даст возможность проводить более целенаправленную профилактику путем воздействия на микробиоту кишечника людей из групп риска. ⁶  

Исследователи ясно дают понять, что этот вывод не противоречит идее о том, что ВИЧ сам по себе может вызывать дисбиоз. Однако, короткая продолжительность исследования не позволила оценить изменения в составе микробиоты кишечника при хронической ВИЧ-инфекции. Кроме того, эти результаты были получены в небольшой группе участников со специфическими характеристиками, и поэтому возможности их переноса на более широкую популяцию ограничены.

Институт микробиоты «Биокодекс» предлагает вам изучить информацию, которая поможет сохранить здоровье микробиоты в праздничный сезон. Желаем вам счастливого Рождества и крепкой микробиоты!

Хорошие решения для ухода за кишечной флорой

Представляем нашу подборку статей:

Оставьте чувство вины — праздники полезны для кишечной микробиоты!

Представляем нашу подборку статей:

По случаю Всемирной недели осведомленности о резистентности к противомикробным препаратам, ежегодно организуемой ВОЗ, Институт микробиоты «Биокодекс» делится собственной информацией.

Как антибиотики влияют на нашу микробиоту?

Антибиотики не всегда различают полезные и вредные бактерии. Они уничтожают не только патогенные бактерии, но и полезные бактерии в микрофлоре кишечника. Эти нарушения снижают бактериальное разнообразие, что ослабляет наши естественные защитные силы и способствует возникновению определенных дисбалансов.

Ознакомьтесь с нашими статьями, чтобы лучше понять, как антибиотики влияют на нашу микробиоту:

Как антибиотики влияют на нашу микробиоту?

Раннее или повторяющееся воздействие антибиотиков может оказать длительное влияние на состав микробиоты и увеличить риск развития иммунных, пищеварительных или аллергических расстройств. Его эффекты не всегда прекращаются по окончании лечения. Их влияние на микробиоту может оставить значительные следы на нашем здоровье. Эти нарушения напоминают нам о важности разумного использования антибиотиков для защиты нашего здоровья в долгосрочной перспективе и ограничения дисбаланса в микробиоте.

Узнайте, как антибиотики могут влиять на наше здоровье с раннего возраста:

В чем причина растущего интереса к антибиотик-ассоциированной диарее?

Пост-антибиотическая диарея является распространенным следствием нарушения микрофлоры кишечника в результате лечения лекарственными препаратами. Изменяя защитную флору, некоторые антибиотики создают условия для нарушения баланса или размножения условно-патогенных бактерий. Восстановление этого баланса необходимо для поддержания здоровья пищеварительной системы.

Ознакомьтесь с нашими статьями, чтобы понять связь между антибиотиками, микробиотой и диареей:

Что такое антибиотикорезистентность?

Резистентность к антибиотикам возникает, когда определенные бактерии перестают погибать под действием лекарств. Антибиотики уничтожают микробы, вызывающие инфекции, но также и другие полезные бактерии. Те, которые оказываются устойчивыми, могут затем размножаться и передавать свою резистентность другим, что затрудняет лечение инфекций.

Ознакомьтесь с нашими статьями, чтобы лучше понять проблему антибиотикорезистентности:

Можем ли мы защитить нашу микробиоту?

В ответ на нарушение, вызванное антибиотиками, существуют решения, которые помогают поддерживать микробиоту: сокращение использования антибиотиков, разнообразное питание и употребление пребиотиков и пробиотиков. Эти средства помогают восстановить бактериальный баланс и уменьшить последствия нарушения, вызванного лечением, что приводит к улучшению общего состояния здоровья.

Узнайте, как сохранить баланс микрофлоры при приеме антибиотиков:

Рекомендовано нашим сообществом

1. Антибиотики спасают жизни

С момента открытия пенициллина в 1928 г. широкое использование антибиотиков спасло миллионы жизней. Это основное оружие в борьбе с бактериальными инфекциями, наряду с прививками добавившее почти 20 лет к ожидаемой продолжительности жизни.¹

2. Антибиотики уничтожают вредные и полезные бактерии

Кишечник, влагалище, легкие, кожа... многие части тела населены микроорганизмами (бактериями, грибами, вирусами). Такие микробные сообщества известны как микробиота.² Антибиотики уничтожают патогенные микробы, вызывающие инфекции, но могут также уничтожать некоторые полезные бактерии в нашей микробиоте, что ведет к дисбалансу (дисбиозу (sidenote: Дисбиоз Изменение состава и функции микробиоты, вызванное сочетанием экологических и индивидуальных факторов. Дисбиоз не является четко очерченным состоянием и варьируется в зависимости от состояния здоровья каждого человека. Levy M, Kolodziejczyk AA, Thaiss CA, et al. Dysbiosis and the immune system. Nat Rev Immunol. 2017;17(4):219-232. ) )³ различной степени выраженности в этих экосистемах.

3. Антибиотики могут вызывать побочные эффекты

Вызывая дисбиоз, антибиотики могут пагубно влиять на здоровье. Основной краткосрочный эффект — нарушение опорожнения кишечника у некоторых пациентов. Чаще всего это диарея, при этом микробиота кишечника хуже выполняет свои защитные функции. Антибиотикоассоциированная диарея обычно имеет легкую или умеренную степень тяжести⁹, а частота ее возникновения зависит от возраста, типа антибиотика, заболевания и других факторов. Ею может страдать до 35%^9,10,11 пациентов и 80% детей.⁹ В 10-20% случаев причиной диареи является инфекция, вызванная бактерией Clostridioides difficile (C. difficile) ¹¹, которая колонизирует микробиоту кишечника и становится патогенной вследствие определенных факторов (например, использования антибиотиков). Клинические последствия варьируются от умеренной диареи до гораздо более серьезных симптомов или даже смерти.¹¹

4. Антибиотики могут вызывать долгосрочные эффекты

Диарея — не единственный симптом антибиотикоассоциированного дисбиоза. Считается, что если он возникает в раннем возрасте, то может вызывать долгосрочные последствия. Перинатальный период, в котором происходит развитие микробиоты кишечника и созревание иммунной системы, — особенно чувствительный период.¹² Развитие антибиотикоассоциированного дисбиоза в это время увеличивает риск возникновения некоторых хронических заболеваний (ожирение, сахарный диабет, бронхиальная астма, воспалительные заболевания кишечника).¹³

 5. Неправильное использование антибиотиков — основная причина развития антибиотикорезистентности (устойчивости к антибиотикам)

Антибиотикорезистентность означает, что антибиотики становятся неэффективны против бактериальных инфекций.¹ В чем причина? Антибиотики эффективны только против бактерий и не влияют на вирусы (например, гриппа).¹⁴ Неправильное (например, при вирусных инфекциях) или чрезмерное использование антибиотиков, у людей или животных, ускоряет развитие устойчивости к ним. Антибиотикорезистентность приводит к более длительным госпитализациям, более высоким расходам на здравоохранение и увеличению смертности. Вот почему это стало серьезной проблемой общественного здравоохранения во всем мире.¹

6. Всемирная неделя правильного использования противомикробных препаратов

Каждый год с 18 по 24 ноября ВОЗ организует Всемирную неделю правильного использования противомикробных препаратов с целью повышения осведомленности о глобальной проблеме устойчивости к антимикробным препаратам, а также чтобы призвать широкую общественность, работников здравоохранения и политиков использовать передовой опыт во избежание дальнейшего появления и распространения лекарственно-устойчивых инфекций. Институт микробиоты Biocodex принимает участие в этой инициативе в качестве эксперта по микробиоте.

Инфографика, которой можно поделиться с пациентами

Что национальный грант позволил открыть в области исследований микробиоты?

Национальный грант позволил детально изучить влияние антибиотикотерапии на качественные и количественные изменения состава кишечной микробиоты, а также на концентрацию и спектр бактериальных метаболитов — короткоцепочечных жирных кислот. Впервые изучено влияние антибиотикотерапии на селективную кишечную проницаемость. Установлена связь между антибактериальной терапией и возникновением симптомов, характерных для функциональных заболеваний желудочно-кишечного тракта.

Что это может значить для пациентов?

Ожидается, что результаты проекта позволят определить дополнительный патогенетический механизм формирования симптомов функциональных заболеваний желудочно-кишечного тракта и станут основой для разработки оптимального способа их профилактики.

BMI 22.20

Что мы уже знаем?

Микробиота кишечника человека образует сложную и сбалансированную экосистему. Нарушения этой экосистемы могут играть роль в развитии инфекций, ожирения, сахарного диабета, а также неврологических и воспалительных заболеваний. Антибиотики добавили от 2 до 10 лет к ожидаемой продолжительности жизни, но воздействие этих препаратов в раннем возрасте связано с неблагоприятными метаболическими, воспалительными и неврологическими эффектами как у животных, так и у человека. Когда микробные сообщества подвергаются воздействию антибиотиков, они не только реагируют, изменяя свой состав, но и эволюционируют, оптимизируя и распространяя гены устойчивости к антибиотикам (гены ABR), в совокупности образующие резистом.[2] Микробиота кишечника человека является резервуаром генов ABR, которые обмениваются между резидентными штаммами, распространяя устойчивость.[3] Появление и распространение антибиотикорезистентных бактерий представляет серьезную угрозу для общественного здравоохранения. Только в нескольких исследованиях изучали влияние конкретных антибиотиков на кишечные экосистемы и связанные с ними резистомы. Показано, что применение антибиотиков вызывает уменьшение разнообразия микробиоты и увеличение носительства генов ABR.[4, 5] Однако влияние комбинации антибиотиков на микробиоту и роль генов ABR в микробной персистенции еще не изучены. В этом исследовании 12 здоровых мужчин в возрасте от 18 до 40 лет получали коктейль из трех антибиотиков последней инстанции (ванкомицин, гентамицин и меропенем). Авторы проанализировали влияние такого «лечения» на микробиоту кишечника путем секвенирования образцов кала, взятых до и в четыре временных точки на протяжении 6-месячного периода после приема антибиотиков.

Каковы основные результаты исследования?

На 4-й день после вмешательства разнообразие и богатство микробиоты заметно снизились по сравнению с исходным уровнем. Однако, несмотря на воздействие антибиотиков очень широкого спектра действия, многие виды все еще обнаруживались на 4-й день (рисунок 1a). На 8-й день разнообразие микробиоты (измеренное по индексу Шеннона) значительно увеличилось, свидетельствуя о начале восстановления сохранившихся микроорганизмов (рисунок 1b). Через 6 месяцев разнообразие микробиоты почти полностью восстановилось до исходного уровня, но это не относилось к богатству, указывая на то, что некоторые штаммы были полностью (или, по крайней мере, в течение длительного времени) уничтожены.

Некоторые ранние изменения включали бурный рост обычно субдоминантных комменсалов, таких как Escherichia coli, Veillonella spp., Klebsiella spp., Enterococcus faecalis и Fusobacterium nucleatum, а также резкое истощение продуцентов бутирата, таких как Faecalibacterium prausnitzii, Roseburia hominis, Anaerostipes hadrus, Coprococcus spp. и Eubacterium spp. Эти сдвиги в составе микробиоты уже не были значимыми на 42-й день.

Затем авторы изучили роль генов ABR в восстановлении микробиоты. В частности, они обнаружили, что метагеномные виды, несущие β-лактамазы, имели значимо более высокие шансы на выживание (ОШ = 1,64 [1,24-2,17]) на 8-й день. Кроме того, метагеномные виды, не выявляемые на исходном уровне, имели лучшие шансы на последующую колонизацию de novo, если несли гены ABR против одного из трех используемых классов антибиотиков.

Что все это значит на практике?

Эти данные показывают, что микробиота кишечника здоровых молодых людей устойчива к 4-дневному курсу антибиотиков широкого спектра действия, однако на восстановление большинства микробных сообществ требуется около 6 месяцев. Восстановление отдельных видов модулируется переносом генов ABR. Необходимы дальнейшие исследования для оценки влияния повторяющейся и/или продолжительной антибиотикотерапии, в том числе у детей с незрелой иммунной системой и микробиотой. Возможно, что повторное использование антибиотиков в течение длительного времени приводит к отбору бактерий, несущих гены ABR, за счет других комменсалов, что может оказывать длительное или постоянное воздействие на микробиоту. В таких случаях может оказаться полезным корректирующее вмешательство с введением экзогенных микроорганизмов. Антибиотики оказывают значимое влияние на кишечную микробиоту, поэтому их следует использовать рационально.

С одной стороны, это выдающееся научное открытие, спасшее миллионы жизней. С другой стороны, чрезмерное использование антибиотиков может привести к возникновению множественных форм резистентности (у бактерий, вирусов, паразитов и грибов). В результате противомикробные препараты становятся все менее эффективными, и, в конечном итоге, если не предпринимать никаких действий, существует риск того, что они больше не смогут защитить нас от инфекций.

Ежегодно резистентность к противомикробным препаратам будет уносить почти 700 000 жизней во всем мире ². Если ничего не изменится, к 2050 году инфекционные заболевания могут стать одной из ведущих причин смерти в мире, унося жизни до 10 миллионов человек ².

Институт микробиоты — крупный экспертный центр по микробиоте и активный партнер мероприятия с 2020 года. В течение ноября Институт будет делиться статьями и новостями, а также видеозаписями экспертов и материалами по ключевым темам, чтобы расширить наши знания и помочь понять как антибиотики влияют на микробиоту человека в среднесрочной и долгосрочной перспективе. Приведем лишь один пример. Несмотря на высокую эффективность против бактерий (и отсутствие эффективности против вирусных инфекций³), они часто вызывают дисбиоз, который связан с несколькими хорошо известными проблемами, такими как антибиотикоассоциированная диарея.

Но это еще не все! Возможно применение антибиотиков, особенно в раннем детстве, повышает риск возникновения некоторых хронических заболеваний ⁴ (аллергия, бронхиальная астма, ожирение, хронические воспалительные заболевания кишечника и т. д.). Можем ли мы что-то сделать? Да! Рационально назначайте антибиотики и следите за тем, чтобы они использовались должным образом! Информируйте пациентов о рисках дисбактериоза, связанных с чрезмерным и неправильным использованием антибиотиков. Мы все несем ответственность и должны прилагать максимум усилий, чтобы помешать дальнейшему развитию устойчивости к противомикробным препаратам!

Начиная с 2015 года ВОЗ ежегодно организует Всемирную неделю правильного использования противомикробных препаратов. С какой целью? Повысить осведомленность медицинских работников и широкой общественности о правильном использовании противомикробных препаратов для борьбы с устойчивостью к антибиотикам. Авторы внесли новые знания о механизмах, посредством которых устойчивость к антимикробным препаратам распространяется по всему миру. В странах с низким и средним уровнем дохода антибиотикорезистентность, как правило, шире распространена, чем в странах с высоким уровнем дохода. Кроме того, способность генов резистентности перемещаться вместе с путешественниками зависит от ряда факторов. Исследователи попытались узнать, способствуют ли путешествия в страны с высоким уровнем устойчивости к определенным антибиотикам распространению генов резистентности в более благополучных регионах.

Международные поездки способствуют приобретению генов резистентности

Чтобы проверить эту гипотезу, ученые обследовали 190 путешественников из Дании (средний возраст: 50,7 года), участвующих в исследовании COMBAT (Carriage Of Multiresistant Bacteria After Travel). Участников разделили на четыре подгруппы в зависимости от региона с высокой устойчивостью к антибиотикам, который они посетили: Юго-Восточная Азия, Южная Азия, Северная Африка или Восточная Африка. Непосредственно до и после поездки у каждого из них брали образец кала. Поездки длились от 1 недели до 3 месяцев.

С помощью таких подходов, как секвенирование методом дробовика, функциональная метагеномика и статистическое моделирование, был проведен тщательный анализ кишечного резистома всех участников. Сравнивая образцы, взятые до и после путешествия, удалось обнаружить рост количества генов антибиотикорезистентности после путешествия. Кроме того, количество генов резистентности было самым высоким у тех, кто вернулся из Юго-Восточной Азии.

одна поездка = 56 генов резистентности

За одну поездку путешественник в среднем приобретал 56 генов резистентности (и терял 4 гена), в основном кодирующих белки, ответственные за выведение антибиотиков из клетки и модификацию их мишеней. Это были классические и хорошо известные гены резистентности [семейство bla_CTX-M (гены резистентности к β-лактамам), mcr-1 (гены резистентности к колистину), варианты tetX (гены резистентности к тетрациклину) и qnr (гены резистентности к фторхинолонам)], а также ранее неизвестные гены. Обнаружилось, что 6 из 56 приобретаемых генов были связаны с посещаемым регионом, например, 3 из этих 6 генов, выявленные у посещавших Юго-Восточную Азию, были вариантами гена dfrA1, придающего устойчивость к триметоприму. Далее, мобильные генетические элементы, обнаруженные наряду с генами резистентности, могут способствовать приобретению еще большего количества последних у тех, кто путешествовал по Юго-Восточной Азии.

Чтобы подстегнуть изучение механизмов распространения устойчивости к антибиотикам, Фонд по изучению микробиоты «Биокодекс» учредил Международный грант на 2022 «Структура и функция резистома микробиоты кишечника». Предпринимаются коллективные и междисциплинарные усилия по борьбе с антибиотикорезистентностью.